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jfwu017

银虫 (小有名气)

[求助] 散尽金三百,求高人解一晶体结构! 已有3人参与

如题。求高手解析一个晶体结构。
注:结构我已经大致解了一下,配体就是初解的配体。空间中有一个带负电的硝酸根定不下来,溶剂可能是甲醇和水分子(可能会有二氯甲烷)。
要求:check cif 不能有A类和B类错误。
由于小弟金币有限,只能拿出全部的304枚金币。谢谢!
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  • 2014-06-12 22:04:58, 497.29 K

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gkmuse

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
jfwu017: 金币+30, 有帮助, 真是辛苦了! 2014-06-15 11:15:03
Alert level C
PLAT052_ALERT_1_C Info on Absorption Correction Method Not Given .     Please Do !
PLAT053_ALERT_1_C Minimum Crystal Dimension Missing (or Error) ...     Please Check
PLAT054_ALERT_1_C Medium  Crystal Dimension Missing (or Error) ...     Please Check
PLAT055_ALERT_1_C Maximum Crystal Dimension Missing (or Error) ...     Please Check
PLAT342_ALERT_3_C Low Bond Precision on  C-C Bonds ...............     0.0100 Ang.  
PLAT420_ALERT_2_C D-H Without Acceptor       N4     -   H4A    ...     Please Check
PLAT420_ALERT_2_C D-H Without Acceptor       N46    -   H46B   ...     Please Check
PLAT731_ALERT_1_C Bond    Calc   1.326(11), Rep    1.326(5) ......          2 su-Rat
              C31  -N46     1.555   1.555                    #         49      
PLAT732_ALERT_1_C Angle   Calc    117.8(7), Rep    117.7(3) ......       2.33 su-Rat
              N4   -C20  -N19     1.555   1.555   1.555      #         59      
PLAT732_ALERT_1_C Angle   Calc    117.3(7), Rep    117.3(3) ......       2.33 su-Rat
              N19  -C40  -C35     1.555   1.555   1.555      #         99      
Alert level G
PLAT003_ALERT_2_G Number of Uiso or Uij Restrained non-H Atoms ...          8 Why ?
PLAT007_ALERT_5_G Number of Unrefined Donor-H Atoms ..............          8 Why ?
PLAT042_ALERT_1_G Calc. and Reported MoietyFormula Strings  Differ     Please Check
PLAT045_ALERT_1_G Calculated and Reported Z Differ by ............       8.00 Ratio
PLAT128_ALERT_4_G Alternate Setting for Input Space-Group     C2/c    I2/c    Note  
PLAT605_ALERT_4_G Structure Contains Solvent Accessible VOIDS of .       1008 A**3  
PLAT790_ALERT_4_G Centre of Gravity not Within Unit Cell: Resd.  #          2 Note  
              Cl                                                               
PLAT860_ALERT_3_G Number of Least-Squares Restraints .............         17 Note  
PLAT868_ALERT_4_G ALERTS Due to the use of _smtbx_masks Suppressed          ! Info

搞不定。为什么会有硝酸根离子?电荷不平是如何看的?为什么电荷不平不行?会不会含有一个氯离子?

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  • 2014-06-13 22:32:55, 3.99 M
C-H
11楼2014-06-13 22:36:33
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beyond-han

金虫 (著名写手)

祝福楼主
祝楼主百尺竿头更进一步

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
做最最最简单的自己
2楼2014-06-12 22:23:40
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若凡01

铁杆木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你能给个邮箱不,我大体弄了一下,你没给出金属和配体的大体结构,你先看看是这个东西吧?
金属有机骨架材料的设计以及性能研究
3楼2014-06-13 00:21:33
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gkmuse

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
新手练习,仅供参考。

Alert level C
PLAT052_ALERT_1_C Info on Absorption Correction Method Not Given .     Please Do !
PLAT053_ALERT_1_C Minimum Crystal Dimension Missing (or Error) ...     Please Check
PLAT054_ALERT_1_C Medium  Crystal Dimension Missing (or Error) ...     Please Check
PLAT055_ALERT_1_C Maximum Crystal Dimension Missing (or Error) ...     Please Check
PLAT220_ALERT_2_C Large Non-Solvent  C     Ueq(max)/Ueq(min) Range        3.1 Ratio
PLAT230_ALERT_2_C Hirshfeld Test Diff for    C17    --  C19     ..        6.8 su   
PLAT230_ALERT_2_C Hirshfeld Test Diff for    C17    --  C31     ..        6.8 su   
PLAT234_ALERT_4_C Large Hirshfeld Difference C1     --  C32     ..       0.16 Ang.  
PLAT242_ALERT_2_C Low       Ueq as Compared to Neighbors for .....        C17 Check
PLAT342_ALERT_3_C Low Bond Precision on  C-C Bonds ...............     0.0118 Ang.  
PLAT731_ALERT_1_C Bond    Calc   1.333(13), Rep    1.333(6) ......          2 su-Rat
              N10  -C37     1.555   1.555                    #         17      
And 2 other PLAT731 Alerts More ...
Alert level G
PLAT040_ALERT_1_G No H-atoms in this Carbon Containing Compound ..     Please Check
PLAT042_ALERT_1_G Calc. and Reported MoietyFormula Strings  Differ     Please Check
PLAT045_ALERT_1_G Calculated and Reported Z Differ by ............       8.00 Ratio
PLAT128_ALERT_4_G Alternate Setting for Input Space-Group     C2/c    I2/c    Note  
PLAT606_ALERT_4_G VERY LARGE Solvent Accessible VOID(S) in Structure        ! Info
PLAT868_ALERT_4_G ALERTS Due to the use of _smtbx_masks Suppressed          ! Info

有些C类错误,也可以被处理掉。抱歉,目前,没时间处理。

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  • 2014-06-13 00:35:36, 4.36 M
C-H
4楼2014-06-13 00:36:09
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