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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体解析 » 【请教】晶体解析中遇到的问题1：怎么降R1/？
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wzgynkmlhf

金虫 (著名写手)

[交流] 【请教】晶体解析中遇到的问题1：怎么降R1/？

小女子自学解析晶体已经一年多了，仍旧纠结于很多问题中，请高手指点，谢谢。
问题是，
1、我已经把自己做的晶体结构解出了大致的框架，就是有个原子不能确定。
我加的金属是Ho(NO3)3 ,CuCl2，在重原子处，Ho，如果换成Cu，那么S值降了，WR2值和R1值都降了，但是各项异性之后，S值降到了2.4左右，WR2=0.4697，R1=0.1446，怎么试也不行。请问是否加氢以后，就可以降值呢？
简单的结构倒是很快的。不知道复杂的结构，初解这些系数要到什么值最好？各项同性前后的值又是多少呢？加氢前后又是多少呢？（大概值）谢谢。
2、初始时候，我输入的元素组成是C H O N Cl Ho Cu，现在解析出来的结构中并没有Cl，我在ins文件中把Cl 删除了再精修，S，WR2 R1都升了大约是刚才的一倍，请有经验的高手指点一二。

非常感谢，自学不易，请指点。

有些东西是书上找不到的，希望您能不吝您的宝贵经验。谢谢。

[ Last edited by wzgynkmlhf on 2011-3-24 at 09:42 ]
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1楼 2011-03-24 09:40:04
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ylhttzj

至尊木虫 (知名作家)
★
wsht212(金币+1): 2011-03-24 14:52:14
可能还有重原子没定好
删除坏点可以降R1
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2楼2011-03-24 10:00:20
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wzgynkmlhf

金虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by ylhttzj at 2011-03-24 10:00:20:
可能还有重原子没定好
删除坏点可以降R1

如何删坏点呢?详细点吧，高人。
还有一个问题就是，我用xprep 的时候，发现有完整度有个段的很低，是不是也会影响呢？ 谢谢。
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3楼2011-03-24 10:12:53
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
wsht212(金币+50): 老师，这100金币送给你，谢谢您对我的指点。因为最近在忙一点事情所以就忘记，非常抱歉希望您能原谅我做事情拖拉的习惯！谢谢您 2011-03-24 14:51:48
wsht212(金币+50): 谢谢老师 2011-03-24 14:51:59
wsht212(金币+1): 谢谢 2011-03-24 14:52:23
是Ho,是Cu,首先要搞清楚， 其配位和键长都不一样的。

S值和权重有关。 每次修完，在.res 中都有推荐值，把原来的w用推荐值代替，再修。

另外， 看来拟的数据较弱， 所以wR太大。

加氢可以降低R1,但一般不明显（对于配合物）
但，各项异性了吗？
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4楼2011-03-24 10:53:45
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)
★ ★
wsht212(金币+2): 谢谢老师 2011-03-24 14:53:20
wzgynkmlhf(金币+100): 谢谢老师。以前请您帮忙解析过一个晶体，虽然金币不多，但是心意谢谢。 2011-03-24 16:18:51
2、初始时候，我输入的元素组成是C H O N Cl Ho Cu，现在解析出来的结构中并没有Cl，我在ins文件中把Cl 删除了再精修，S，WR2 R1都升了大约是刚才的一倍，请有经验的高手指点一二。


这个删不删cl，按理和R值是没有关系的。
但可能，
你删了Cl后， Ho，Cu分别从SFAC中的第6和第七位元素变成第5和第6个元素了。
而你的原子列表中确没有相应改过来

比如

Cu1 7 x y z 11.0

删除cl后，应改为
Cu1 6 x y z 11.0
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5楼2011-03-24 10:56:50
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wzgynkmlhf

金虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by xi2004 at 2011-03-24 10:53:45:
是Ho,是Cu,首先要搞清楚， 其配位和键长都不一样的。

S值和权重有关。 每次修完，在.res 中都有推荐值，把原来的w用推荐值代替，再修。

另外， 看来拟的数据较弱， 所以wR太大。

加氢可以降低R1,但一般不 ...

老师您好：
非常感谢您的回复。
我的问题继续存在；
1、初解，系统给出的Ho，我换成Cu，S值和WR2，R1都下降了。我应该按照Ho来精修，还是按照Cu来精修呢？因为改了系统推荐的元素名称。
2、我严格按照一个很详细的教程做的，W值也用了推荐的，各项同性，各项异性都做了的
3、在这个难以确定究竟是原子周围，精修后一直有个峰，和金属Ho(Cu)相隔很近，键长大约就在0.3左右，删除以后又会长出来的。然后一直都会有这个峰出现，请教。谢谢
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7楼2011-03-24 16:26:30
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huahua1216

至尊木虫 (文坛精英)
★
wzgynkmlhf(金币+1):谢谢参与
引用回帖:
Originally posted by wzgynkmlhf at 2011-03-24 16:26:30:
老师您好：
非常感谢您的回复。
我的问题继续存在；
1、初解，系统给出的Ho，我换成Cu，S值和WR2，R1都下降了。我应该按照Ho来精修，还是按照Cu来精修呢？因为改了系统推荐的元素名称。
2、我严格按照一个很 ...

重原子周围可能有拖尾效应 可以注意一下
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8楼2011-03-24 16:42:38
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ifent

金虫 (小有名气)
★
wzgynkmlhf(金币+1):谢谢参与
我也不是高手，对你的问题提点意见仅供参考
1、首先，稀土离子和过渡离子与N，O配位键长差别很大，而且一般稀土离子很少有六配位的，一眼可以看出来。修改原子在ins里改就行。

2、goof值是由权重决定的，至于能不能把R1值解到合理范围，很大程度上取决于数据的质量，如果Rint值很高，是很难把R1值降低的。
3、你说的金属旁的大Q峰一般叫做鬼峰，是重原子效应引起的，可以接受。
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9楼2011-03-24 17:18:36
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liyaoman46楼
2011-03-24 12:13   回复  
引用回帖:
Originally posted by xi2004 at 2011-03-24 10:56:50: 2、初始时候，我输入的元素组成是C H O N Cl Ho Cu，现在解析出来的结构中并没有Cl，我在ins文件中把Cl 删除了再精修，S，WR2 R1都升了大约是刚才的一倍，请有经验的高手指点一二。 这个删不删cl，按理和R值 ...

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