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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体解析 » 求助：晶体解析中键角有关问题！谢谢
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bsnow

木虫 (小有名气)

[求助] 求助：晶体解析中键角有关问题！谢谢

晶体为吡啶脲（含 C H N O原子）与CoSO4 培养所得，其中硫酸根上的氧原子在震动，Co原子为六配位结构，目前一条审稿意见如下：
Sulfate disorder appears to be adequately modelled.  


180 degree bond-angles with senseless s.u. values
--------------------------------------------------
In the CIF the 180° bond-angle values with senseless s.u. values
should be corrected and should appear as integer 180°.  
[These senseless s.u. values arise because of known problem in SHELXL
when the central atom is on an inversion centre.]

审稿人首先提到硫酸根的无序处理的还可以，然后空一行后又提到180度键角含有无意义的偏差值。
目前我比较困惑的是：1 他所说的180键角含有无意义的偏差值指的是那个原子，是SO4周围无序的氧原子还是Co周围的配位情况啊（目前CIF中键角接近180的只有Co周围的原子）？？；2  应该如何修正才能正好得到整数为180的键角呢？？

比较着急，非常感谢各位！！！！
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1楼 2011-07-05 20:38:35
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huahua1216

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

★
bsnow(金币+10): xieixe 2011-07-05 22:08:12
drg1984(金币+1): 感谢回帖！ 2011-07-06 09:27:26
如果你的Co是在特殊点上的话180的角度就是没有误差的 检查一下
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2楼2011-07-05 21:32:02
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bsnow

木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by huahua1216 at 2011-07-05 21:32:02:
如果你的Co是在特殊点上的话180的角度就是没有误差的 检查一下

感觉Co原子应该不是处于特殊位置的。
Co原子是六配位，分别是一个甲醇分子的O6,两个水分子：O4 和O5，三个吡啶N原子：N1,N4和N9
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3楼2011-07-05 22:12:04
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huahua1216

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

★
bsnow(金币+10): 谢谢！ 2011-07-06 08:53:43
drg1984(金币+1): 感谢回帖！ 2011-07-06 09:27:34
bsnow(金币+40): xiexie 2011-07-11 18:38:47
引用回帖:
Originally posted by bsnow at 2011-07-05 22:12:04:
感觉Co原子应该不是处于特殊位置的。
Co原子是六配位，分别是一个甲醇分子的O6,两个水分子：O4 和O5，三个吡啶N原子：N1,N4和N9

看一下res里面他的占有率是11 还是10.5或其他？
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4楼2011-07-06 08:52:26
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bsnow

木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by huahua1216 at 2011-07-06 08:52:26:
看一下res里面他的占有率是11 还是10.5或其他？

Co的占有率是1.0，不过正文部分描述时说Co周围的三个氮原子处于经式，这是不是暗示Co周围的原子间应该为180呢？谢谢！！
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5楼2011-07-06 08:56:45
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cuifj

金虫 (正式写手)
★
drg1984(金币+1): 感谢回帖！ 2011-07-06 09:27:42
我认为是Co周围的原子
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没有想不到的，只有做不到的！
6楼2011-07-06 09:02:13
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huahua1216

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

★
drg1984(金币+1): 感谢回帖！ 2011-07-06 09:27:49
bsnow(金币+20): 谢谢您的热情回复！我好像知道是怎么回事了··· 2011-07-06 19:08:57
bsnow(金币+20): 谢谢！谢谢！ 2011-07-11 14:54:12
引用回帖:
Originally posted by bsnow at 2011-07-06 08:56:45:
Co的占有率是1.0，不过正文部分描述时说Co周围的三个氮原子处于经式，这是不是暗示Co周围的原子间应该为180呢？谢谢！！

我觉得你可以贴个Co的配位环境图 并且给出res中Co周围成键的信息
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7楼2011-07-06 09:22:45
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bsnow

木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by huahua1216 at 2011-07-06 09:22:45:
我觉得你可以贴个Co的配位环境图 并且给出res中Co周围成键的信息

真的很感谢您！
可能是我开始没理解审稿人意思，他在第四个晶体审稿意见后边打了一个回车后写的这条意见，这可能就意味着这条意见不是针对第四个晶体，而是所有的数据。目前我将所有晶体数据都看了一下，好像是与第三个晶体的数据相关（CIF中含有180的键角，且有偏差），呵呵 这也是经别人指点才顿悟的。
总之，谢谢大家了哈！！
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8楼2011-07-06 19:14:03
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yangzaiwen06

木虫 (正式写手)
贴个Co的配位环境图 并且给出res中Co周围成键的信息
找到Cu的成键环境也行
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9楼2011-07-11 14:59:29
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