24小时热门版块排行榜    

查看: 1546  |  回复: 8

bsnow

木虫 (小有名气)

[求助] 求助:晶体解析中键角有关问题!谢谢

晶体为吡啶脲(含 C H N O原子)与CoSO4 培养所得,其中硫酸根上的氧原子在震动,Co原子为六配位结构,目前一条审稿意见如下:
Sulfate disorder appears to be adequately modelled.  


180 degree bond-angles with senseless s.u. values
--------------------------------------------------
In the CIF the 180° bond-angle values with senseless s.u. values
should be corrected and should appear as integer 180°.  
[These senseless s.u. values arise because of known problem in SHELXL
when the central atom is on an inversion centre.]

审稿人首先提到硫酸根的无序处理的还可以,然后空一行后又提到180度键角含有无意义的偏差值。
目前我比较困惑的是:1 他所说的180键角含有无意义的偏差值指的是那个原子,是SO4周围无序的氧原子还是Co周围的配位情况啊(目前CIF中键角接近180的只有Co周围的原子)??;2  应该如何修正才能正好得到整数为180的键角呢??

比较着急,非常感谢各位!!!!
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

huahua1216

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖


bsnow(金币+10): xieixe 2011-07-05 22:08:12
drg1984(金币+1): 感谢回帖! 2011-07-06 09:27:26
如果你的Co是在特殊点上的话180的角度就是没有误差的 检查一下
2楼2011-07-05 21:32:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bsnow

木虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by huahua1216 at 2011-07-05 21:32:02:
如果你的Co是在特殊点上的话180的角度就是没有误差的 检查一下

感觉Co原子应该不是处于特殊位置的。
Co原子是六配位,分别是一个甲醇分子的O6,两个水分子:O4 和O5,三个吡啶N原子:N1,N4和N9
3楼2011-07-05 22:12:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

huahua1216

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖


bsnow(金币+10): 谢谢! 2011-07-06 08:53:43
drg1984(金币+1): 感谢回帖! 2011-07-06 09:27:34
bsnow(金币+40): xiexie 2011-07-11 18:38:47
引用回帖:
Originally posted by bsnow at 2011-07-05 22:12:04:
感觉Co原子应该不是处于特殊位置的。
Co原子是六配位,分别是一个甲醇分子的O6,两个水分子:O4 和O5,三个吡啶N原子:N1,N4和N9

看一下res里面他的占有率是11 还是10.5或其他?
4楼2011-07-06 08:52:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bsnow

木虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by huahua1216 at 2011-07-06 08:52:26:
看一下res里面他的占有率是11 还是10.5或其他?

Co的占有率是1.0,不过正文部分描述时说Co周围的三个氮原子处于经式,这是不是暗示Co周围的原子间应该为180呢?谢谢!!
5楼2011-07-06 08:56:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cuifj

金虫 (正式写手)


drg1984(金币+1): 感谢回帖! 2011-07-06 09:27:42
我认为是Co周围的原子
没有想不到的,只有做不到的!
6楼2011-07-06 09:02:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

huahua1216

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖


drg1984(金币+1): 感谢回帖! 2011-07-06 09:27:49
bsnow(金币+20): 谢谢您的热情回复!我好像知道是怎么回事了··· 2011-07-06 19:08:57
bsnow(金币+20): 谢谢!谢谢! 2011-07-11 14:54:12
引用回帖:
Originally posted by bsnow at 2011-07-06 08:56:45:
Co的占有率是1.0,不过正文部分描述时说Co周围的三个氮原子处于经式,这是不是暗示Co周围的原子间应该为180呢?谢谢!!

我觉得你可以贴个Co的配位环境图 并且给出res中Co周围成键的信息
7楼2011-07-06 09:22:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bsnow

木虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by huahua1216 at 2011-07-06 09:22:45:
我觉得你可以贴个Co的配位环境图 并且给出res中Co周围成键的信息

真的很感谢您!
可能是我开始没理解审稿人意思,他在第四个晶体审稿意见后边打了一个回车后写的这条意见,这可能就意味着这条意见不是针对第四个晶体,而是所有的数据。目前我将所有晶体数据都看了一下,好像是与第三个晶体的数据相关(CIF中含有180的键角,且有偏差),呵呵 这也是经别人指点才顿悟的。
总之,谢谢大家了哈!!
8楼2011-07-06 19:14:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yangzaiwen06

木虫 (正式写手)

贴个Co的配位环境图 并且给出res中Co周围成键的信息
找到Cu的成键环境也行
9楼2011-07-11 14:59:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 bsnow 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 307求调剂 +11 冷笙123 2026-03-17 11/550 2026-03-22 20:16 by edmund7
[考研] 289求调剂 +7 怀瑾握瑜l 2026-03-20 7/350 2026-03-22 15:57 by ColorlessPI
[考研] 319求调剂 +4 小力气珂珂 2026-03-20 4/200 2026-03-22 15:53 by ColorlessPI
[考研] 303求调剂 +5 安忆灵 2026-03-22 6/300 2026-03-22 12:46 by 素颜倾城1988
[考研] 求调剂 +7 Auroracx 2026-03-22 7/350 2026-03-22 12:38 by 素颜倾城1988
[考研] 280求调剂 +11 咕噜晓晓 2026-03-18 12/600 2026-03-21 22:40 by ACS Nano——
[考研] 化学调剂 +5 yzysaa 2026-03-21 5/250 2026-03-21 22:12 by peike
[考研] 材料求调剂 +5 @taotao 2026-03-21 5/250 2026-03-21 20:55 by lbsjt
[考研] 求调剂 +4 要好好无聊 2026-03-21 4/200 2026-03-21 18:57 by 学员8dgXkO
[考研] 0805 316求调剂 +3 大雪深藏 2026-03-18 3/150 2026-03-21 18:55 by 学员8dgXkO
[考研] 材料 271求调剂 +5 展信悦_ 2026-03-21 5/250 2026-03-21 17:29 by 学员8dgXkO
[考研] 299求调剂 +5 shxchem 2026-03-20 7/350 2026-03-21 17:09 by ColorlessPI
[考研] 268求调剂 +9 简单点0 2026-03-17 9/450 2026-03-21 15:37 by lature00
[考研] 307求调剂 +3 wyyyqx 2026-03-17 3/150 2026-03-21 03:20 by JourneyLucky
[考研] 083200学硕321分一志愿暨南大学求调剂 +3 innocenceF 2026-03-17 3/150 2026-03-21 02:35 by JourneyLucky
[考研] 求调剂,一志愿:南京航空航天大学大学 ,080500材料科学与工程学硕,总分289分 +4 @taotao 2026-03-19 4/200 2026-03-20 22:14 by JourneyLucky
[考研] 295材料求调剂,一志愿武汉理工085601专硕 +5 Charlieyq 2026-03-19 5/250 2026-03-20 20:35 by JourneyLucky
[考博] 申博26年 +3 八6八68 2026-03-19 3/150 2026-03-19 19:43 by nxgogo
[考研] 一志愿福大288有机化学,求调剂 +3 小木虫200408204 2026-03-18 3/150 2026-03-19 13:31 by houyaoxu
[考研] 277调剂 +5 自由煎饼果子 2026-03-16 6/300 2026-03-17 19:26 by 李leezz
信息提示
请填处理意见