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bsnow

木虫 (小有名气)

[求助] 求助:晶体解析中键角有关问题!谢谢

晶体为吡啶脲(含 C H N O原子)与CoSO4 培养所得,其中硫酸根上的氧原子在震动,Co原子为六配位结构,目前一条审稿意见如下:
Sulfate disorder appears to be adequately modelled.  


180 degree bond-angles with senseless s.u. values
--------------------------------------------------
In the CIF the 180° bond-angle values with senseless s.u. values
should be corrected and should appear as integer 180°.  
[These senseless s.u. values arise because of known problem in SHELXL
when the central atom is on an inversion centre.]

审稿人首先提到硫酸根的无序处理的还可以,然后空一行后又提到180度键角含有无意义的偏差值。
目前我比较困惑的是:1 他所说的180键角含有无意义的偏差值指的是那个原子,是SO4周围无序的氧原子还是Co周围的配位情况啊(目前CIF中键角接近180的只有Co周围的原子)??;2  应该如何修正才能正好得到整数为180的键角呢??

比较着急,非常感谢各位!!!!
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huahua1216

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖


bsnow(金币+10): 谢谢! 2011-07-06 08:53:43
drg1984(金币+1): 感谢回帖! 2011-07-06 09:27:34
bsnow(金币+40): xiexie 2011-07-11 18:38:47
引用回帖:
Originally posted by bsnow at 2011-07-05 22:12:04:
感觉Co原子应该不是处于特殊位置的。
Co原子是六配位,分别是一个甲醇分子的O6,两个水分子:O4 和O5,三个吡啶N原子:N1,N4和N9

看一下res里面他的占有率是11 还是10.5或其他?
4楼2011-07-06 08:52:26
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huahua1216

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖


bsnow(金币+10): xieixe 2011-07-05 22:08:12
drg1984(金币+1): 感谢回帖! 2011-07-06 09:27:26
如果你的Co是在特殊点上的话180的角度就是没有误差的 检查一下
2楼2011-07-05 21:32:02
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bsnow

木虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by huahua1216 at 2011-07-05 21:32:02:
如果你的Co是在特殊点上的话180的角度就是没有误差的 检查一下

感觉Co原子应该不是处于特殊位置的。
Co原子是六配位,分别是一个甲醇分子的O6,两个水分子:O4 和O5,三个吡啶N原子:N1,N4和N9
3楼2011-07-05 22:12:04
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bsnow

木虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by huahua1216 at 2011-07-06 08:52:26:
看一下res里面他的占有率是11 还是10.5或其他?

Co的占有率是1.0,不过正文部分描述时说Co周围的三个氮原子处于经式,这是不是暗示Co周围的原子间应该为180呢?谢谢!!
5楼2011-07-06 08:56:45
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