应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » CIF专栏 » 求助一个晶体的拓扑结构及拓扑分析
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
91/1返回列表
查看: 3210  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

烟波钓徒de

木虫 (正式写手)

[求助] 求助一个晶体的拓扑结构及拓扑分析 已有2人参与

本人现有一个晶体结构，由于是3D结构想分析其拓扑结构，自己对于拓扑不是很懂，之前摸索了一下TOPOS4，OLEX，DIAMOND，都不得其要领，因而在此求助各位topos高手分析一下，cIf文件已上传，不甚感激！
回复此楼

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : 1.cif
    • 2014-03-14 12:30:12, 31.91 K

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2014-03-14 12:30:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

情化钾

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
烟波钓徒de: 金币+10, ★★★很有帮助 2014-03-14 21:55:08
你可以用mercury，简单易学，比diamond好用的多，可以使用short contact命令看生长方式，或者calculate--packing/slicing中pack后生长看3维结构的生长方式，还有从配位模式上来分析，是几配位几面体，是否有H键作用，是否有π堆积，基本就是这几个方面了
赞一下 回复此楼
2楼2014-03-14 15:20:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

烟波钓徒de

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 情化钾 at 2014-03-14 15:20:30
你可以用mercury，简单易学，比diamond好用的多，可以使用short contact命令看生长方式，或者calculate--packing/slicing中pack后生长看3维结构的生长方式，还有从配位模式上来分析，是几配位几面体，是否有H键作用 ...

感谢您的回复，我之前用mercury看过了，金属离子是八配位的，和六个配体配位，1个配体是和6个金属配位，生成的一维链通过配体连接成3D结构，至于堆积方面，由于溶剂分子全部被删除，所以看不出H键，我用olex处理后不知道如何进行节点选择，所以很头疼，能否帮忙看一下，万分感谢！
赞一下 回复此楼
3楼2014-03-14 21:52:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

情化钾

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by 烟波钓徒de at 2014-03-14 21:52:40
感谢您的回复，我之前用mercury看过了，金属离子是八配位的，和六个配体配位，1个配体是和6个金属配位，生成的一维链通过配体连接成3D结构，至于堆积方面，由于溶剂分子全部被删除，所以看不出H键，我用olex处理后 ...

你用platon检测看有无氢键，溶剂分子需保留，有的话在diamond中绘制，我可以代劳

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下 回复此楼
4楼2014-03-15 00:34:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

烟波钓徒de

木虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 情化钾 at 2014-03-15 00:34:03
你用platon检测看有无氢键，溶剂分子需保留，有的话在diamond中绘制，我可以代劳
...

这个晶体不是我自己解的，是别人帮我弄出来的，当时帮忙解的人说溶剂分子不确定，所以解出来后溶剂分子未保留，发给我的文件就只有CIF以及RES文件，其余的就没有看见，要不我把原始的晶体数据发给您看看，我这个就是毕业论文里面需要说明一下拓扑结构和拓扑分析，如果弄好了有重谢。
赞一下 回复此楼
5楼2014-03-15 11:40:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

情化钾

金虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 烟波钓徒de at 2014-03-15 11:40:29
这个晶体不是我自己解的，是别人帮我弄出来的，当时帮忙解的人说溶剂分子不确定，所以解出来后溶剂分子未保留，发给我的文件就只有CIF以及RES文件，其余的就没有看见，要不我把原始的晶体数据发给您看看，我这个就 ...

解晶体我也不擅长，实在是爱莫能助。H键什么的就先不写了吧
赞一下 回复此楼
6楼2014-03-15 15:31:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

烟波钓徒de

木虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 情化钾 at 2014-03-15 15:31:17
解晶体我也不擅长，实在是爱莫能助。H键什么的就先不写了吧...

嗯那好，没有问题只要能够把拓扑结构弄出来就行，其余的都没有多大关系的
赞一下 回复此楼
7楼2014-03-18 09:45:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lwyzky
8楼2014-03-18 10:01:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

crystal701

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

{4^11.6^4}
Topological type: 6/4/t7; sqc885
赞一下 回复此楼
9楼2014-06-02 00:41:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 烟波钓徒de 的主题更新
91/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 0702物理学学硕299求调剂 +3 祁柒连 2026-04-06 3/150 2026-04-07 12:48 by 小木虫gyh
[考研] 华南理工0703化学，总分336求调剂 +10 手机用户 2026-04-03 11/550 2026-04-06 22:20 by michael2011
[考研] 0855求调剂材料 +11 红桃灼灼 2026-04-04 12/600 2026-04-06 10:26 by 蓝云思雨
[考研] 一志愿C9的化学工程（085602） 340分，感觉校内调剂无望，求调剂 +12 万事宜臻 2026-04-04 12/600 2026-04-06 07:46 by 无际的草原
[考研] 302分 085601求调剂推荐 +11 zyx上岸！ 2026-04-05 11/550 2026-04-05 22:13 by dongzh2009
[考研] 22408 总分320，一篇论文二作，两个国三，求调剂 +3 Leomulufu 2026-04-04 5/250 2026-04-05 19:04 by chongya
[考研] 348求调剂 +6 wukira 2026-04-04 6/300 2026-04-05 18:11 by 猪会飞
[考研] 工科求调剂 +15 11ggg 2026-04-03 15/750 2026-04-05 16:24 by zzx2138
[考研] 272求调剂 +4 电气李 2026-04-05 4/200 2026-04-05 10:41 by lbsjt
[考研] 材料调剂 +9 革微桂 2026-04-04 9/450 2026-04-05 08:27 by 544594351
[考研] 材料调剂 +18 一样YWY 2026-04-02 19/950 2026-04-04 22:14 by hemengdong
[考研] 325求调剂 +4 春风不借意 2026-04-04 4/200 2026-04-04 14:46 by 湘农储能材料
[考研] 357求调剂 +13 1050389037 2026-04-03 13/650 2026-04-03 22:27 by 无际的草原
[考研] 303求调剂 +3 一色清羽 2026-04-02 4/200 2026-04-03 10:22 by 蓝云思雨
[考研] 279求调剂 +6 qazplm0852 2026-04-02 6/300 2026-04-03 10:03 by 蓝云思雨
[考研] 材料考研调剂 +10 Gs大王 2026-04-02 10/500 2026-04-03 09:47 by 遗忘消失的灆
[考研] 一志愿深大085601材料工程专业（专硕）300分可以调剂去哪 +8 10160315 2026-04-02 8/400 2026-04-03 09:36 by hypershenger
[考研] 266求调剂 +4 学员97LZgn 2026-04-02 4/200 2026-04-02 09:52 by yulian1987
[考研] 材料求调剂 +10 呢呢妮妮 2026-04-01 13/650 2026-04-02 09:17 by olim
[考研] 一志愿北京科技，085601总分305求调剂 +9 半生瓜！ 2026-04-01 11/550 2026-04-02 08:28 by Wang200018
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭