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横刀

铜虫 (小有名气)

[求助] 关于MS建模中取代盒子特定区域的溶剂分子的方法 已有1人参与

文献中的建模方法如下所述。请问各位高手,用烷烃油滴取代盒子中心球形区域内的CO2分子是怎么做到的?如能解惑,不胜感激!

关于MS建模中取代盒子特定区域的溶剂分子的方法
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关于MS建模中取代盒子特定区域的溶剂分子的方法-1
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cl1994861

金虫 (小有名气)

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2楼: Originally posted by 邺城独客 at 2015-05-26 21:05:48
使用Atom selection 先选定CO2盒子中心的一个原子,然后以这个原子为中心,以20A为半径作球形区域,再将选中的球形区域的CO2分子全部delete,然后构建一个半径为20A的烷烃球形团簇,复制粘贴到原先删除CO2分子后所形 ...

关于你说的把球形团簇复制粘贴到原球形空缺处,我复制粘贴后它并不在那个空缺处,难道只能通过上下左右移动使它到那个球形区域?那怎么保证它能够准确地在那个位置?
7楼2017-09-15 15:19:22
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金虫 (小有名气)

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2楼: Originally posted by 邺城独客 at 2015-05-26 21:05:48
使用Atom selection 先选定CO2盒子中心的一个原子,然后以这个原子为中心,以20A为半径作球形区域,再将选中的球形区域的CO2分子全部delete,然后构建一个半径为20A的烷烃球形团簇,复制粘贴到原先删除CO2分子后所形 ...

关于你说的把球形团簇复制粘贴到原球形空缺处,我复制粘贴后它并不在那个空缺处,难道只能通过上下左右移动使它到那个球形区域?那怎么保证它能够准确地在那个位置?
8楼2017-09-15 15:19:29
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金虫 (小有名气)

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2楼: Originally posted by 邺城独客 at 2015-05-26 21:05:48
使用Atom selection 先选定CO2盒子中心的一个原子,然后以这个原子为中心,以20A为半径作球形区域,再将选中的球形区域的CO2分子全部delete,然后构建一个半径为20A的烷烃球形团簇,复制粘贴到原先删除CO2分子后所形 ...

关于你说的把球形团簇复制粘贴到原球形空缺处,我复制粘贴后它并不在那个空缺处,难道只能通过上下左右移动使它到那个球形区域?那怎么保证它能够准确地在那个位置?
9楼2017-09-15 15:19:35
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金虫 (小有名气)

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2楼: Originally posted by 邺城独客 at 2015-05-26 21:05:48
使用Atom selection 先选定CO2盒子中心的一个原子,然后以这个原子为中心,以20A为半径作球形区域,再将选中的球形区域的CO2分子全部delete,然后构建一个半径为20A的烷烃球形团簇,复制粘贴到原先删除CO2分子后所形 ...

关于你说的把球形团簇复制粘贴到原球形空缺处,我复制粘贴后它并不在那个空缺处,难道只能通过上下左右移动使它到那个球形区域?那怎么保证它能够准确地在那个位置?
10楼2017-09-15 15:19:45
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金虫 (小有名气)

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2楼: Originally posted by 邺城独客 at 2015-05-26 21:05:48
使用Atom selection 先选定CO2盒子中心的一个原子,然后以这个原子为中心,以20A为半径作球形区域,再将选中的球形区域的CO2分子全部delete,然后构建一个半径为20A的烷烃球形团簇,复制粘贴到原先删除CO2分子后所形 ...

关于你说的把球形团簇复制粘贴到原球形空缺处,我复制粘贴后它并不在那个空缺处,难道只能通过上下左右移动使它到那个球形区域?那怎么保证它能够准确地在那个位置?
11楼2017-09-15 15:20:00
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