应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 关于MS建模中取代盒子特定区域的溶剂分子的方法
121/2返回列表12下一页
查看: 1577  |  回复: 11
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

横刀

铜虫 (小有名气)

[求助] 关于MS建模中取代盒子特定区域的溶剂分子的方法 已有1人参与

文献中的建模方法如下所述。请问各位高手，用烷烃油滴取代盒子中心球形区域内的CO2分子是怎么做到的？如能解惑，不胜感激！

关于MS建模中取代盒子特定区域的溶剂分子的方法
无标题.jpg


关于MS建模中取代盒子特定区域的溶剂分子的方法-1
无标题2.jpg
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2015-05-26 20:52:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

邺城独客

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
横刀: 金币+15, ★★★很有帮助 2015-05-28 09:57:37
使用Atom selection 先选定CO2盒子中心的一个原子，然后以这个原子为中心，以20A为半径作球形区域，再将选中的球形区域的CO2分子全部delete，然后构建一个半径为20A的烷烃球形团簇，复制粘贴到原先删除CO2分子后所形成的球形空缺处即可。
赞一下(2人) 回复此楼
2楼2015-05-26 21:05:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

邺城独客

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
横刀: 金币+15, ★★★很有帮助 2015-05-28 09:57:48
引用回帖:
4楼: Originally posted by 横刀 at 2015-05-27 09:21:27
请问如何做球形区域并选中里面的CO2呢...

先选中中心处的一个原子，再Edit--Atom Selection，将select by property设置成Radial Distance,半径设为20A，选择Within，再点击select。在盒子里面这样操作可能会出现提示对话框，楼主可以试一下。。
赞一下(1人) 回复此楼
5楼2015-05-27 11:24:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
比较好奇球形的团簇怎么构建
赞一下 回复此楼
#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
3楼2015-05-27 08:27:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

横刀

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 邺城独客 at 2015-05-26 21:05:48
使用Atom selection 先选定CO2盒子中心的一个原子，然后以这个原子为中心，以20A为半径作球形区域，再将选中的球形区域的CO2分子全部delete，然后构建一个半径为20A的烷烃球形团簇，复制粘贴到原先删除CO2分子后所形 ...

请问如何做球形区域并选中里面的CO2呢
赞一下 回复此楼
4楼2015-05-27 09:21:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

横刀

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 邺城独客 at 2015-05-27 11:24:30
先选中中心处的一个原子，再Edit--Atom Selection，将select by property设置成Radial Distance,半径设为20A，选择Within，再点击select。在盒子里面这样操作可能会出现提示对话框，楼主可以试一下。。...

那怎么选中心处的原子呢？
赞一下 回复此楼
6楼2015-05-27 16:07:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cl1994861

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 邺城独客 at 2015-05-26 21:05:48
使用Atom selection 先选定CO2盒子中心的一个原子，然后以这个原子为中心，以20A为半径作球形区域，再将选中的球形区域的CO2分子全部delete，然后构建一个半径为20A的烷烃球形团簇，复制粘贴到原先删除CO2分子后所形 ...

关于你说的把球形团簇复制粘贴到原球形空缺处，我复制粘贴后它并不在那个空缺处，难道只能通过上下左右移动使它到那个球形区域？那怎么保证它能够准确地在那个位置？
赞一下 回复此楼
7楼2017-09-15 15:19:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cl1994861

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 邺城独客 at 2015-05-26 21:05:48
使用Atom selection 先选定CO2盒子中心的一个原子，然后以这个原子为中心，以20A为半径作球形区域，再将选中的球形区域的CO2分子全部delete，然后构建一个半径为20A的烷烃球形团簇，复制粘贴到原先删除CO2分子后所形 ...

关于你说的把球形团簇复制粘贴到原球形空缺处，我复制粘贴后它并不在那个空缺处，难道只能通过上下左右移动使它到那个球形区域？那怎么保证它能够准确地在那个位置？
赞一下 回复此楼
8楼2017-09-15 15:19:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cl1994861

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 邺城独客 at 2015-05-26 21:05:48
使用Atom selection 先选定CO2盒子中心的一个原子，然后以这个原子为中心，以20A为半径作球形区域，再将选中的球形区域的CO2分子全部delete，然后构建一个半径为20A的烷烃球形团簇，复制粘贴到原先删除CO2分子后所形 ...

关于你说的把球形团簇复制粘贴到原球形空缺处，我复制粘贴后它并不在那个空缺处，难道只能通过上下左右移动使它到那个球形区域？那怎么保证它能够准确地在那个位置？
赞一下 回复此楼
9楼2017-09-15 15:19:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cl1994861

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 邺城独客 at 2015-05-26 21:05:48
使用Atom selection 先选定CO2盒子中心的一个原子，然后以这个原子为中心，以20A为半径作球形区域，再将选中的球形区域的CO2分子全部delete，然后构建一个半径为20A的烷烃球形团簇，复制粘贴到原先删除CO2分子后所形 ...

关于你说的把球形团簇复制粘贴到原球形空缺处，我复制粘贴后它并不在那个空缺处，难道只能通过上下左右移动使它到那个球形区域？那怎么保证它能够准确地在那个位置？
赞一下 回复此楼
10楼2017-09-15 15:19:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 横刀 的主题更新
121/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 311求调剂 +6 冬十三 2026-03-18 6/300 2026-03-22 20:18 by edmund7
[考研] 求调剂一志愿海大，0703化学学硕304分，有大创项目，四级已过 +6 幸运哩哩 2026-03-22 10/500 2026-03-22 20:10 by edmund7
[考研] 284求调剂 +5 Zhao anqi 2026-03-22 5/250 2026-03-22 17:38 by barlinike
[考研] 305分求调剂（食品工程） +4 Sxy112 2026-03-21 6/300 2026-03-22 15:26 by 无懈可击111
[考研] 一志愿华中科技大学071000，求调剂 +4 沿岸有贝壳6 2026-03-21 4/200 2026-03-22 07:21 by ilovexiaobin
[考研] 化学调剂 +5 yzysaa 2026-03-21 5/250 2026-03-21 22:12 by peike
[考研] 302求调剂 +12 呼呼呼。。。。 2026-03-17 12/600 2026-03-21 17:29 by ColorlessPI
[考研] 296求调剂 +4 www_q 2026-03-20 4/200 2026-03-21 17:26 by 学员8dgXkO
[考研] 求调剂 +3 白QF 2026-03-21 3/150 2026-03-21 13:12 by zhukairuo
[考研] 332求调剂 +3 凤凰院丁真 2026-03-20 3/150 2026-03-21 10:27 by luoyongfeng
[考研] 346求调剂[0856] +4 WayneLim327 2026-03-16 7/350 2026-03-21 04:02 by JourneyLucky
[考研] 材料工程（专）一志愿985 初试335求调剂 +3 hiloiy 2026-03-17 4/200 2026-03-21 03:04 by JourneyLucky
[考研] 一志愿华南师大 070300（化学）304分求调剂 +3 0703武芊慧雪304 2026-03-18 3/150 2026-03-21 00:48 by JourneyLucky
[考研] 求调剂，一志愿:南京航空航天大学大学 ，080500材料科学与工程学硕，总分289分 +4 @taotao 2026-03-19 4/200 2026-03-20 22:14 by JourneyLucky
[考研] 一志愿西南交通 专硕 材料355 本科双非 求调剂 +5 西南交通专材355 2026-03-19 5/250 2026-03-20 21:10 by JourneyLucky
[考研] 一志愿南理工085701环境302求调剂院校 +3 葵梓卫队 2026-03-20 3/150 2026-03-20 19:28 by zhukairuo
[考研] 0703化学调剂 +4 18889395102 2026-03-18 4/200 2026-03-19 16:13 by 30660438
[考研] 考研调剂 +3 淇ya_~ 2026-03-17 5/250 2026-03-17 09:25 by Winj1e
[考研] [导师推荐]西南科技大学国防/材料导师推荐 +3 尖角小荷 2026-03-16 6/300 2026-03-16 23:21 by 尖角小荷
[考研] 070303 总分349求调剂 +3 LJY9966 2026-03-15 5/250 2026-03-16 14:24 by xwxstudy
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭