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seamas_gao1银虫 (小有名气)
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刚拿到全基因组，想做全基因组关联分析，需要准备什么？ 已有2人参与
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我们大课题组干了快两年，马上就要拿到一个养殖动物的全基因组了。现在在计划下一步的方向。小弟对这个方向不是太懂，想请教一下，如果做全基因组关联分析，是否还要先做高密度snp芯片？还需要准备什么前期工作？谢谢！ [ 发自手机版 http://muchong.com/3g ] |
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seamas_gao1
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seamas_gao1: 金币+80, ★★★★★最佳答案 2015-05-25 08:30:20
seamas_gao1: 金币+80, ★★★★★最佳答案 2015-05-25 08:30:20
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做GWAS很烧钱的噢。你这个不是模式生物，没有现成的商业化芯片，要自己定制，那还不如直接上重测序做GWAS。GWAS最关键的就是性状调查，一定要准确。后面的数据分析都是成熟的套路了。 如果没那么多钱，就好好挖一下基因组吧。仔细读读近五六年在Nature、Science、NG等高水平期刊上发的全基因组测序论文，然后对比一下DNA Res这种低水平期刊上的基因组测序论文，好好学学牛人们是怎么用基因组做功能、编故事的。 |
6楼2015-05-20 14:03:40
wangningbo
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