应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 蛋白质与小分子进行刚性对接时，蛋白质需要能量最小化吗？
51/1返回列表
查看: 2409  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

楼1970-01-01 08:00:00
已阅   申请模拟EPI   回复此楼   编辑   查看我的主页

智能机器人

Robot (super robot)

我们都爱小木虫

找到一些相关的精华帖子，希望有用哦~

科研从小木虫开始，人人为我，我为人人

chenglong_li

铁杆木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
对接所用若是蛋白晶体结构的话，其是不含氢的，需要先添加氢。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
赞一下 回复此楼
为天地立心，为生民立命，为往圣继绝学，为万世开太平。
4楼2015-05-09 16:25:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

wbf3ng

金虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
你的蛋白质结构哪来的？手工画的吗？一般是晶体结构，就不需能量最小化了。

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下 回复此楼
2楼2015-05-08 19:00:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bobbycn

木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
优化下氢吧，位点残基用受体柔性对接处理

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下 回复此楼
3楼2015-05-09 07:30:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

超人与小木虫

金虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
应该需要加氢优化，因为在bound和unbound状态下，蛋白构象具有差异。先对unbound(晶体结构)状态进行优化，再进行对接，考虑配体周围残基的柔性（主链和侧链），这样对接后可以和unbound做对比，找出构象差异，也可说明配体结合后诱导蛋白构象发生变化。
赞一下 回复此楼
超人不会飞
5楼2015-05-10 13:53:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭