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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Monte Carlo » towhee 力场参数
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hjy2940

铜虫 (小有名气)

[求助] towhee 力场参数 已有1人参与

请问一般怎么修改towhee中的力场参数呢？
高手们能不能分享下基本思路
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材料
1楼 2015-04-21 23:35:50
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992648352

银虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by hjy2940 at 2015-04-22 08:10:08
谢谢！我添加了一些类型。不知道谁注意过OPLS-AA参数没有：
软件里的bond 和 angle的系数 K 值 是参考文献里值的一半，torsion coefficient是参考文献值得1/4，想确认下...

你可以查询软件中的键类型和文献中的区别，应该有区别的http://towhee.sourceforge.net/towhee_ff.html！
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4楼2015-04-22 10:20:54
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992648352

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
hjy2940: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2015-04-22 08:05:13
不能自己按照格式写吗？修改的话，直接对应的参数更改数值就行了，但是其他细节的注意，比如1-4作用，键角函数形式，一致的话直接更改，不一致的话连同函数类型一起改了。
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2楼2015-04-22 07:57:11
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hjy2940

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 992648352 at 2015-04-22 07:57:11
不能自己按照格式写吗？修改的话，直接对应的参数更改数值就行了，但是其他细节的注意，比如1-4作用，键角函数形式，一致的话直接更改，不一致的话连同函数类型一起改了。

谢谢！我添加了一些类型。不知道谁注意过OPLS-AA参数没有：
软件里的bond 和 angle的系数 K 值 是参考文献里值的一半，torsion coefficient是参考文献值得1/4，想确认下
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材料
3楼2015-04-22 08:10:08
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hjy2940

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by hjy2940 at 2015-04-22 20:54:24
我都分别对上了相同的类型，系数还是都除了2。要不都改过来还是发信问问？
你们用的力场的参数跟文献中是完全一样的？...

ff文件中确实要除2，最后生成的data file中的值就是是文献中给出的值，因为表达方式的问题
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材料
6楼2015-04-22 23:41:38
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