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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » lammps输入用的data文件，键，角度，二面角获得结果。石墨烯模型包含500个原子
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Ergon

金虫 (著名写手)

[求助] lammps输入用的data文件，键，角度，二面角获得结果。石墨烯模型包含500个原子已有1人参与

lammps输入文件里边势函数用到键、角、二面角、命令。
用materials studio 建立了石墨烯模型，想导出键、角、二面角。特此求助。
据说ms2lmp能导出，但是导出的有错误。
不用materials studio建模。其它软件建模也行。
特此求助：望大神解答。
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认真生活
1楼2015-04-21 23:09:00
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pl816

禁虫 (小有名气)
本帖内容被屏蔽
7楼2020-01-04 16:27:37
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Ergon

金虫 (著名写手)
暂时用gview看原子序数与坐标，键角二面角是找的规律加上的。
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认真生活
2楼2015-05-12 19:40:51
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三岁薇恩

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

VMD建模得到的data文件有这些信息，但是请问哪些势函数需要哪些势函数不需要呢？我也在用LAMMPS跑石墨烯纳米带的MD模拟。
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3楼2019-11-12 10:59:58
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spike111

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 三岁薇恩 at 2019-11-12 10:59:58
VMD建模得到的data文件有这些信息，但是请问哪些势函数需要哪些势函数不需要呢？我也在用LAMMPS跑石墨烯纳米带的MD模拟。

请问我用VMD建模graphene有角、二面角的信息，建模cnt（碳管）就没有角信息，二面角等，应该怎么处理？我觉得cnt的角相互作用应该很重要，只是对相互作用是不足的，对吗？
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4楼2019-11-15 09:52:37
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