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木木up

铜虫 (初入文坛)

[求助] 叶绿体引物筛选

本人是做谱系地理的,还处于菜鸟水平。现有8个居群、七对引物,要从中筛选出多态性高的两三对引物用于cpDNA片段的测序,具体应该怎么做?从每个居群中挑选出一两个个体分别用七对引物做PCR后,接下来要怎么作比较?是直接作电泳,还是得送出去测序后才能判断?
另,有没有比较通用的适合于做叶绿体DNA PCR的反应体系和程序参数?
先谢谢各位了。
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小小逍遥人

金虫 (正式写手)

张斌猪

直接电泳,电泳是定性,也可以去做Qpcr。你这个平常PCR程序就好
生命还需要奇迹来衬托
2楼2015-04-22 09:15:04
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木木up

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 小小逍遥人 at 2015-04-22 09:15:04
直接电泳,电泳是定性,也可以去做Qpcr。你这个平常PCR程序就好

怎样判断呢?哪对引物能在更多的个体中扩增出来,就说明该引物多态性高么?
3楼2015-04-23 08:59:02
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小小逍遥人

金虫 (正式写手)

张斌猪

引用回帖:
3楼: Originally posted by 木木up at 2015-04-23 08:59:02
怎样判断呢?哪对引物能在更多的个体中扩增出来,就说明该引物多态性高么?...

也可以这样理解
生命还需要奇迹来衬托
4楼2015-04-23 12:11:30
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木木up

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 小小逍遥人 at 2015-04-23 12:11:30
也可以这样理解...

好的,谢谢了。
5楼2015-04-24 08:28:53
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