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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 叶绿体引物筛选
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木木up

铜虫 (初入文坛)

[求助] 叶绿体引物筛选

本人是做谱系地理的，还处于菜鸟水平。现有8个居群、七对引物，要从中筛选出多态性高的两三对引物用于cpDNA片段的测序，具体应该怎么做？从每个居群中挑选出一两个个体分别用七对引物做PCR后，接下来要怎么作比较？是直接作电泳，还是得送出去测序后才能判断？
另，有没有比较通用的适合于做叶绿体DNA PCR的反应体系和程序参数？
先谢谢各位了。
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1楼 2015-04-21 10:02:32
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小小逍遥人

金虫 (正式写手)

张斌猪
直接电泳，电泳是定性，也可以去做Qpcr。你这个平常PCR程序就好
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生命还需要奇迹来衬托
2楼2015-04-22 09:15:04
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木木up

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 小小逍遥人 at 2015-04-22 09:15:04
直接电泳，电泳是定性，也可以去做Qpcr。你这个平常PCR程序就好

怎样判断呢？哪对引物能在更多的个体中扩增出来，就说明该引物多态性高么？
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3楼2015-04-23 08:59:02
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小小逍遥人

金虫 (正式写手)

张斌猪
引用回帖:
3楼: Originally posted by 木木up at 2015-04-23 08:59:02
怎样判断呢？哪对引物能在更多的个体中扩增出来，就说明该引物多态性高么？...

也可以这样理解
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生命还需要奇迹来衬托
4楼2015-04-23 12:11:30
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木木up

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 小小逍遥人 at 2015-04-23 12:11:30
也可以这样理解...

好的，谢谢了。
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5楼2015-04-24 08:28:53
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