| 查看: 1736 | 回复: 2 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
Insecta_A铜虫 (小有名气)
|
[交流]
关于popGene数据输入的问题
|
||
|
我是利用SSR标记分析蚜虫遗传多样性，现在进行的是SSR引物筛选，通过PAGE图看到有多态性的引物共9个位点，然后想分析这9个位点在5个地理种群中的等位基因数、等位基因频率、Ne、h、PIC。我已经把每个位点的0,1矩阵转换好了，但是就是不知道咋转换成popgene需要的格式？ 我在看网上的教程时，有这样几个疑问（蚜虫为单倍体）： 1.Number of populations 就是指那5个地理种群么？如果是，下面同一种群的不同个体他们的O,1矩阵几乎是相同的吧？ 2.Number of loci 是总的PAGE条带数么？还是其他什么意思？ 3.locus name 是位点数（我的是9）还是所有条带数（我的为41）？ 4.数据中的每一行是啥意思？是不是就是同一地理种群的其中一个个体在所有位点上的0,1数据？就是这里我不知道咋整哦，比如我的数据 M35-1 M35-2 M35-3 M35-4 M35-5 M35-6（位点M35中出现的6条带） ES-1 0 1 1 1 0 1（ES、PS、FD、BJ、WS代表地理种群，1、2、3代表每个地理种群的不同个体） ES-2 0 1 1 1 0 1 ES-3 0 1 1 1 0 1 PS-1 1 0 0 1 0 0 PS-2 1 0 0 1 0 0 PS-3 1 0 0 1 0 0 FD-1 1 0 1 0 0 0 FD-2 1 0 1 0 0 0 FD-3 1 0 1 0 0 0 BJ-1 1 0 0 0 1 0 BJ-2 1 0 0 0 1 0 BJ-3 1 0 0 0 1 0 WS-1 0 1 0 1 1 1 WS-2 0 1 0 1 1 1 WS-3 0 1 0 1 1 1 这是其中一个位点，我应该怎么输入？请各位大虾帮忙，谢谢！ |
回复此楼» 猜你喜欢
江苏省优青门槛
已经有20人回复
-
心好累。今年我们部门提交了18个项目。中了11了，可惜我的又挂了
已经有10人回复
-
植物学论文润色/翻译怎么收费?
已经有265人回复
-
面上项目计划书
已经有7人回复
-
面上项目计划书附件
已经有9人回复
-
面上项目计划书系统状态
已经有18人回复
-
NSFC-UNEP（与联合国环境规划署）合作项目
已经有33人回复
-
和伊朗人合作
已经有32人回复
-
江苏省自然基金
已经有8人回复
-
生命科学新英文普刊《INVESTIGATION OF LIFE SCIENCE》
已经有11人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- ISSR分子标记中用Popgene计算相关参数时样本量的问题
已经有16人回复
- 数据的方差分析
已经有5人回复
- 求问PopGene软件数据文件内数据排列问题
已经有16人回复
- 布鲁克海文公司的激光粒度分析仪 如何进行数据转换
已经有3人回复
- 什么软件可以算出平均遗传相似系数，NTSYS貌似导不出来EXCEL格式的数据，所以没办法算
已经有3人回复
- 种植资源多样性及亲缘关系分析都要计算哪些数据呀
已经有6人回复
- 基因芯片数据生物学分析结果，大家帮我看看：
已经有4人回复
- 【求助/交流】AFLP矩阵结果如何用popgene分析
已经有13人回复
- 【求助】安装intel的数据库mkl，输入许可文件地址后,提示无效
已经有5人回复
- 【求助】将MS数据文件转化成lammps data
已经有25人回复
Insecta_A
铜虫 (小有名气)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 3
- 散金: 1
- 帖子: 51
- 在线: 8.1小时
- 虫号: 3340323
- 注册: 2014-07-26
- 性别: GG
- 专业: 农业昆虫学
3楼2015-04-20 23:05:04
