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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 基因芯片数据生物学分析结果，大家帮我看看：
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fghostyun6

新虫 (初入文坛)

[交流] 基因芯片数据生物学分析结果，大家帮我看看： 已有3人参与

最近让 biopharm soft公司帮我做了一个基因芯片的结果生物学意义分析，部分内容如下：（我想问的是GOID是什么？ Count他们告诉我是指富集分析的频数，怎么理解？）


Gene        GO        GOID
A2ML1        protein binding        GO:5515
A2ML1        regulation of endopeptidase activity        GO:52548
A2ML1        serine-type endopeptidase inhibitor activity        GO:4867
ABCD1        ATP binding        GO:5524
ABCD1        ATPase activity        GO:16887
ABCD1        ATPase activity, coupled to transmembrane movement of substances        GO:42626
ABCD1        identical protein binding        GO:42802
ABCD1        integral to membrane        GO:16021
.....

他们还帮我分析了前10个最重要的基因功能，也是类似的结果：

GO        COUNT
protein binding        325
nucleus        198
cytoplasm        185
regulation of transcription, DNA-dependent        163
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BPS
1楼 2011-07-07 14:20:03
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cdl007

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
西瓜(金币+3): 鼓励应助！ 2011-07-07 22:44:18
go 是一个很好用的数据库，gene ontology
翻译成汉语可以叫基因本源，
主页 www.geneontology.org

GOID就是 GO数据库里的ID号

count就是频度，就是这个功能里有多少基因这种理解吧。。。不是很确定

最近在研究这个数据
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2楼2011-07-07 22:34:48
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gayalynau

铁杆木虫 (著名写手)

嗨
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
试问50K的SNP芯片，数据如何分析
赞一下(1人) 回复此楼
嗨
3楼2011-07-09 18:07:01
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fghostyun6

新虫 (初入文坛)
你的SNP芯片数据格式是什么样子的？贴一点点出来，看看能不能看懂
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BPS
4楼2011-07-13 09:47:45
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zjlahzj

新虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
你们的基因芯片是这么制作的,有没有用喷墨打印制作的
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5楼2011-08-08 09:30:32
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