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xja1830

木虫 (正式写手)

[求助] 关于高斯优化配合物结构问题 已有1人参与

本人新手,目前能对一般有机分子DFT 优化和能量计算、基态激发态进行计算,但是我主要研究配位催化。请问高手我想优化两个简单的底物和铜盐结合的配合物,并比较理论配位键长短。分子如图。我是要先进行配体优化在加上金属再优化还是直接优化配合物?配位键是用实键画出来还是可以不画?用的什么方法什么基组比较好?好像配合物带金属一般要加上
****
Cu 0
LANL2DZ
****
是在哪加?这又是什么意思?我的结构都是在guass view里画的,在cauculate里编辑文件的。

关于高斯优化配合物结构问题
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以一颗执着不变的心,勇往直前,迎向未来。
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xja1830

木虫 (正式写手)

为什么没有高手应助呢?还是我自己看帖子解决的。配合物采用混合基组直接优化就可以了。使用B3LYP 方法,LANL2DZ/6-31G**基组优化就可以了。我之前优化过含多氢键D-A结构,可以不用将氢键画出来,只要在氢键作用距离内就可以,配位键也可以。
以一颗执着不变的心,勇往直前,迎向未来。
2楼2015-04-21 15:23:18
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xtulidan

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by xja1830 at 2015-04-21 15:23:18
为什么没有高手应助呢?还是我自己看帖子解决的。配合物采用混合基组直接优化就可以了。使用B3LYP 方法,LANL2DZ/6-31G**基组优化就可以了。我之前优化过含多氢键D-A结构,可以不用将氢键画出来,只要在氢键作用距离 ...

想请问配位键怎么画,金属可以写成离子形式吗
3楼2015-07-06 19:25:46
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郭鹏tao

铜虫 (初入文坛)

你好,想问一下用Chew3D画了导到高斯怎么画
4楼2015-07-22 15:52:51
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xja1830

木虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 郭鹏tao at 2015-07-22 15:52:51
你好,想问一下用Chew3D画了导到高斯怎么画

这个没用过。不是都用guassian view画的吗?
以一颗执着不变的心,勇往直前,迎向未来。
5楼2015-07-22 19:56:21
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阿克飞顿

金虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by xtulidan at 2015-07-06 19:25:46
想请问配位键怎么画,金属可以写成离子形式吗...

您好,我也想问这个问题。我想建一个如图1的络合物模型,这个模型中金是带+1价的,我优化出来的模型如图2
通过电荷分析显示Au带一定的负价,所以我想问问是不是我的模型构建方法或者计算方法有误。输入文件也附上:图3
请您百忙之中能帮我看一下,
关于高斯优化配合物结构问题-1
图1.png


关于高斯优化配合物结构问题-2
图2.png


关于高斯优化配合物结构问题-3
图3.jpg

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  • 2015-09-23 21:44:14, 1.21 K
6楼2015-09-23 21:45:41
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zl541165446

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

我想请问通过在不知道结合位点的情况下,可以通过高斯筛选出金属离子和碱基结合的位点吗?求大神回复!
7楼2016-03-21 13:44:56
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