24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2025年硕士研究生招生接受调剂公告
查看: 4427  |  回复: 15
本帖产生 1 个 1ST强帖 ,点击这里进行查看
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

无所谓109

银虫 (正式写手)

[求助] vasp计算带电粒子吸附计算的问题已有3人参与

最近想计算带电粒子在催化剂表面的吸附性质,但是看了手册,和坛子里的介绍,发现对于slab模型,对整个体系加入电荷(NELECT控制),好像计算是有问题的....
这个帖子有过说明http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=8266545&fpage=1&target=blank
http://cms.mpi.univie.ac.at/vasp/vasp/FAQ.html最后五段
vasp官方FAQ中也有过解答。

问题:
1、针对slab模型,调节NELECT去结构优化,是不是完全没有意义
      对一个电中性条件下已优化好的结构(CONTCAR_1),其能量为E1,然后对CONTCAR_1加一个电子并结构优化得到带电下的稳定结构(CONTCAR_2),计算CONTCAR_2在电中性下的能量E2,比较E1和E2来说明材料带电对其结构的影响。这样做有没有意义。对于官方教程,我的理解是带电后,会产生一个静电场,使得能量不准。如果我不横向比较能量(比较带电前后),有没有意义  

2、如果给体系(slab)带上一个电子,然后去吸附电中性的小分子,在这种条件下,所有的能量全是建立在带一个电子的基础上,这样比较吸附的过程能量变化有没有意义。

3、最近也看到过 对体系(slab)加电子模拟,在催化剂表面上超氧负离子O2-还原过程,这么做有没有意义

4、仔细分析了一下啊,产生这些问题的原因都是调控NELECT不能精准地把电子加到某个原子上,有没有其他的软件固定原子的所带的电荷?如果有请告知一下。
      PS:曾经在坛子里看到有说改POTCAR中电子的数目,来调控带电,仔细分析,这样做确实可以调节外来带电粒子A-(slab结构总不含A元素)的电荷,并且把电荷局域到A上,但是POTCAR太深奥,不敢改,也就没有试过...有没有哪位试过,或者看到过类似的做法,希望告知。

非计算出身,自学的vasp,对于理论基础把握不到位,请大家指导。

vasp计算带电粒子吸附计算的问题
1.jpg
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

弛豫

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

向金字塔顶攀登
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

无所谓109

银虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 卡开发发 at 2015-03-30 18:29:28
研究一下IDIPOL相关的关键字,偶极校正的信息论坛能找出来不少。...

好的,谢谢您!
向金字塔顶攀登
5楼2015-03-30 19:00:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 16 个回答

卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流。。。。 2015-03-31 10:18:55
franch: 1ST强帖+1, 应助指数+1, 鼓励交流。。。。 2015-03-31 10:22:58
无所谓109: 金币+20 2015-07-25 20:55:15
VASP那个FAQ第五段似乎给出了方案。
1、不见得没意义,以往无法处理过剩电荷原因是因为单胞内带有电荷会导致库伦发散。现在不少程序允许使用凝胶模型,引入背景电荷与过剩电荷相互作用来克服发散的问题。如果不能够使用凝胶模型,那应该是无法进行计算的。但即便如此,过剩电荷可能会引起体系的两个slab之间出现静电作用,比较合适的做法是足够的真空层(最好也考虑work function的校正)。当然,这样的做法可能多少还是存在一些争议。

2、你指的是Mol(-)+Slab=Mol-Slab(-)?这样应该还是可行的吧。3也类似,前提是都是要符合1中提到的条件。

4、这个问题必须搞清楚原理,化合价只是个经典形式电荷的问题,在量子物理中,电子是离域的,强行使之局域在某个原子根本无意义(由于方法缺陷导致的该局域而不局域又是另外一码事)。

不必调整POTCAR,直接指定NELECT结果原则上应该没什么不同吧。还望进一步讨论。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

不一定挂在论坛,计算问题问题欢迎留言。
2楼2015-03-29 23:45:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

无所谓109

银虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by 卡开发发 at 2015-03-29 23:45:56
VASP那个FAQ第五段似乎给出了方案。
1、不见得没意义,以往无法处理过剩电荷原因是因为单胞内带有电荷会导致库伦发散。现在不少程序允许使用凝胶模型,引入背景电荷与过剩电荷相互作用来克服发散的问题。如果不能够 ...

谢谢您的解答,现在对这个问题弄明白了些。早上就分析了一下我的结果,把表面静电势导出来看了看。发现加了电子后,我体系两个slab之间确实存在比较明显的静电场的影响。

您提到的work function校正,能不能简要说说校正方法,之前没处理过work function校正,在坛子里也没有找到相关的计算方法。
vasp计算带电粒子吸附计算的问题-1
1.jpg


vasp计算带电粒子吸附计算的问题-2
12.jpg

向金字塔顶攀登
3楼2015-03-30 16:06:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

引用回帖:
3楼: Originally posted by 无所谓109 at 2015-03-30 16:06:34
谢谢您的解答,现在对这个问题弄明白了些。早上就分析了一下我的结果,把表面静电势导出来看了看。发现加了电子后,我体系两个slab之间确实存在比较明显的静电场的影响。

您提到的work function校正,能不能简要 ...

研究一下IDIPOL相关的关键字,偶极校正的信息论坛能找出来不少。
不一定挂在论坛,计算问题问题欢迎留言。
4楼2015-03-30 18:29:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 291求调剂,想找调剂保底的合适的学校 +10 18756999868 2025-04-06 10/500 2025-04-06 22:35 by 外圆内方--
[考研] 360求调剂 +7 茌恩. 2025-04-03 7/350 2025-04-06 17:14 by calebby
[考研] 资源与环境290求调剂 +11 lllll刘lll 2025-03-31 11/550 2025-04-05 23:09 by 二哥先生
[考研] 一志愿吉林大学化学297分求调剂 +5 Clayden66 2025-04-02 5/250 2025-04-05 21:23 by 远博要上岸
[考研] 320调剂 5+3 qwe起泡泡 2025-04-03 11/550 2025-04-05 12:52 by jiaruihuang
[考研] 294分一志愿长春理工大学物理学专业代码070200求调剂 +3 新能源科学与工� 2025-04-04 5/250 2025-04-04 23:47 by 新能源科学与工�
[考研] 0703化学352求调剂 +10 yqwerfdfjj 2025-04-02 11/550 2025-04-04 23:15 by 河大薇薇
[考研] 求好点的调剂 +3 qxy030114 2025-04-03 3/150 2025-04-04 22:18 by zhy_pillar
[考研] 288求调剂 +8 张yc11 2025-04-03 8/400 2025-04-04 17:58 by 芜卿枫叶
[考研] 材料与化工284调剂 +6 老田的暖手宝 2025-04-03 6/300 2025-04-04 09:09 by 考研人15000
[考研] 数一英一机械求调剂 +4 某原84625 2025-04-03 4/200 2025-04-03 21:03 by upczlm1989
[考研] 考研调剂 +9 小阿泰a 2025-04-03 9/450 2025-04-03 20:51 by Ade.
[考研] 0805材料科学与工程328本2求调剂 +6 修。。。。 2025-04-01 7/350 2025-04-03 15:15 by 修。。。。
[考研] 275求调剂 +3 考上研究生啦 2025-04-02 3/150 2025-04-03 14:26 by 褚迎松小小
[考研] 302求调剂 +3 E路前行 2025-04-02 3/150 2025-04-03 13:54 by fmesaito
[考研] 化工调剂 +17 19834069615 2025-04-01 17/850 2025-04-03 13:46 by njfuzzj
[考研] 求调剂 +12 糖糖糖lu 2025-03-31 13/650 2025-04-03 00:55 by 诗与自由
[考研] 求调剂 +11 寄于心 2025-04-02 13/650 2025-04-02 23:35 by siwuhen
[论文投稿] Nano Letter变为二区了??? +3 Adhfjf 2025-04-01 3/150 2025-04-02 18:00 by cftgs12
[考研] 328求调剂 +3 @南风听 2025-04-02 5/250 2025-04-02 17:22 by @南风听
信息提示
请填处理意见
濠㈣泛绉烽惁顖滄嫬閸愩劌顣�濠㈣泛绉烽惁顖滄嫬閸愩劌顣�
濠㈣泛绉烽惁顖滄嫬閸愩劌顣�濞存粌鐬煎ǎ顕€鎯嶉敓锟�闁兼儳鍢茶ぐ鍥ㄥ緞瀹ュ牏妲� & 閻犲鍟晶蹇涘箰閸パ冪闁挎冻鎷�鐎甸偊鍠曟穱濠囧箥椤愶紕顏遍柟纰夋嫹
闁哥喎妫楁慨鐔煎触閸粎绋�闁哥喎妫楁慨鐔煎触閸粎绋�
闁哥喎妫楁慨鐔煎触閸粎绋�濞存粌鐬煎ǎ顕€鎯嶉敓锟�闁哥喎妫楁慨鐔煎触閸粎绋婇柛婧垮姀椤曪拷鐎甸偊鍠曟穱濠囧箥椤愶紕顏遍柟纰夋嫹(濠㈣泛娲﹂弫鐐烘晬濮橆剚娅岄柛鏂衡偓铏€ゅù锝忔嫹)
閻庢冻闄勫﹢鎶界嵁閼艰埖褰�閻庢冻闄勫﹢鎶界嵁閼艰埖褰�
閻庢冻闄勫﹢鎶界嵁閼艰埖褰�濞存粌鐬煎ǎ顕€鎯嶉敓锟�鐎甸偊鍠曟穱濠囧箥椤愶紕顏遍柟纰夋嫹濞存粌妫滆闁哄牃鍋撻柡鍌涙緲椤掔喖寮甸姘彙閻犳劧鎷�
閻犱胶鍎ら弸鍐╂綇閸涱収鍤�閻犱胶鍎ら弸鍐╂綇閸涱収鍤�
閻犱胶鍎ら弸鍐╂綇閸涱収鍤�濞存粌鐬煎ǎ顕€鎯嶉敓锟�鐎甸偊鍠曟穱濠囧箥椤愶紕顏遍柟纰夋嫹婵烇綀顕ф慨鐐烘嚀娴e摜鐟庨柨娑樿嫰閸樸倗鎷归悷鐗堝皰閻犲浄鎷�
閻㈩垰鐗愮粊顐﹀箯濞戞ê鐝�閻㈩垰鐗愮粊顐﹀箯濞戞ê鐝�