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小范范1989木虫 (著名写手)
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[交流]
高斯view怎么样固定分子的对称性进行优化？
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首先，说明一下我的问题： 1：我用高斯view画出分子，计算后，发现自己分子的homo和lumo与实验上的homo和lumo符合不上， 因为分子是D-A-D的分子，按说应该homo在两个D上，实验上画出来的是在两个D上，然而，我自己画出来的却在一个D上，从表面来看，我的应该是错误的。但是，我对我算出来的分子，计算频率，没有虚频的出现。不知道为什么？ 2：解决的办法，是不是在高斯view中固定分子的对成型来优化？我看了高斯view固定对成型的设置，但是我的就是一个c1对称。 3：我问sob，sob给我的回复，附带贴上来。但是，不是很理解 4：针对我的问题，谢谢您的解答。 ps，附带的图片。  2-我的homo.png  sob2.png  sob的回复1.png  文章的homo.png  2-我的homo.png  sob的回复1.png  sob2.png  文章的homo.png  2-我的homo.png  sob的回复1.png  sob2.png |
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小范范1989: 金币+8, thanks 2015-03-30 07:53:27
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额，懒一点的话可以先用MS建模，这大概是最简单的了。Gaussian如果初始结构不具备对称性，那么计算过程始终不会按照对称性来进行处理。 MS下，将模型一直微调，微调后在Build-Symmetry中Find Symmetry并且Impose，找对称性的步长可以大一些，不断微调并且Find Symmetry直至能够Find出你所要的对称性为止，之后将xsd文件export为pdb文件导出再通过GV打开即可。 当然，可能还有更多的方法来建立一个具有对称性的分子。 |
10楼2015-03-29 23:58:30
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