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基因家族研究 已有2人参与
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小弟新手，刚刚接触生物信息。目前在做激素合成通路的基因家族研究。 公司给了我一些挑选出的相关基因序列（我们这个物种的基因组正在测，还没发布，所以是公司找的），我用blastp和blastn对这些序列进行重新筛选。大多数是从ATG开始的。 （1）请问这些序列在进行设计引物前，都需要进行哪些分析呢？多重比对？保守区域？ORF？ （2）在设计引物时候，如何找基因序列的保守区域？请大神详细说一下，我用clustal找，就是看到好多地方标了*，但是这样的区域有很多gap，什么样的区域才可以用来设计引物呢？ （3）另外，家族内部的不同‘亚基因’间在设计引物时，是不是要选择不同的保守区，避开之间相似的保守区域呢？要是设计在同一个保守区域，会不会出现扩增时候，扩出来多个基因的情况啊？ 请大家帮忙啦，我实在是自己琢磨不明白。 |
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