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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 干扰/敲除 » 拟南芥突变体T-DNA插入突变
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bayu18

新虫 (正式写手)

[求助] 拟南芥突变体T-DNA插入突变 已有4人参与

我买了拟南芥一个基因的两个T-DNA插入突变体，插入位置都是在外显子部分，已经筛选到突变纯合体，可是两个突变体的表型存在挺大差异，请教各位大侠：同一个基因的突变，可能是什么原因导致它们表型的不同？   万分感谢！！！！！
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1楼 2015-03-26 08:10:14
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sun_in_night

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2015-03-26 10:44:46
bayu18: 金币+1 2015-03-29 19:23:03
这和你的蛋白的重要功能基团的位置有关。比如mutant A的插入位点比较靠前，在功能基团的位置之前，那么mutant A很有可能就是表型比较严重的一个。而如果mutant B的插入位点比较靠后，在重要的功能基团之后，那么mutant B 就很有可能是表型比较轻的一个。

并不是T-DNA插入基因就不表达了，只是插入位点之后的序列不表达了。你可以做个RT-PCR，插入位点之前的序列还是有的，只是插入序列之后的被破坏了。
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2楼2015-03-26 10:10:31
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bayu18

新虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by sun_in_night at 2015-03-26 10:10:31
这和你的蛋白的重要功能基团的位置有关。比如mutant A的插入位点比较靠前，在功能基团的位置之前，那么mutant A很有可能就是表型比较严重的一个。而如果mutant B的插入位点比较靠后，在重要的功能基团之后，那么mut ...

我的是插入靠前的表型较轻，插入靠后的表型较重。
T-DNA插入后，不论插入位置在哪，转录就不能形成完整的mRNA，就不会形成原来的蛋白质吧。
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3楼2015-03-27 22:26:41
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starseacow

专家顾问 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
bayu18: 金币+3, ★★★很有帮助, 很有道理 2015-03-29 19:22:22
TDNA也可能同时插在不同位点上，你在网上查到的资料只鉴定了一个插入位点，可能某个tdna株系还插入影响了别的蛋白表达。最近关于ABP1的争议性结果有可能是因为这个

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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植物生理群69993869，为避免广告，申请加入请提供木虫昵称，院校及专业信息
4楼2015-03-28 06:50:22
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sun_in_night

木虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by bayu18 at 2015-03-27 02:26:41
我的是插入靠前的表型较轻，插入靠后的表型较重。
T-DNA插入后，不论插入位置在哪，转录就不能形成完整的mRNA，就不会形成原来的蛋白质吧。...

那有可能是多点插入吧，有其他位置的插入影响了，不只是你的基因位置
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5楼2015-03-28 08:30:23
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digitalbio

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
bayu18: 金币+1 2015-03-29 19:23:44
考虑一下竞争性抑制。插入靠后的蛋白长，关键结合区域与正常蛋白竞争底物，导致无功能。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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6楼2015-03-29 07:07:05
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稻稻

铜虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
引用回帖:
3楼: Originally posted by bayu18 at 2015-03-27 22:26:41
我的是插入靠前的表型较轻，插入靠后的表型较重。
T-DNA插入后，不论插入位置在哪，转录就不能形成完整的mRNA，就不会形成原来的蛋白质吧。...

那是不是可以推测靠后的序列是该基因发挥功能的核心序列呢？

[ 发自小木虫客户端 ]
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做一个不动声色的人，不准情绪化，不准回头看。
7楼2015-03-29 07:38:51
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sun_in_night

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

也可能是dominant negative吧，通过互作或竞争导致的。有些点突变导致的变异就比T-DNA的mutant的表型更严重，就是这个原因。
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8楼2015-03-29 09:54:27
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