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空谷新苗木虫 (小有名气)
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用vasp做结构参数的优化时输出文件中只有一组体积-能量数据，求解答。
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我是参照侯老师《入门指南》中的一个脚本来算的，但输出的EtVo.dat文件中只有一组体积-能量数据，麻烦大家看看是不是我的脚本有问题。 脚本： #!bin/sh rm WAVECAR for i in 4.09 4.19 4.29 4.39 4.49 4.59 4.69 4.79 4.89 4.99 5.09do cat > POSCAR <<! TiO2 1 4.594000000000000 0.000000000000000 0.000000000000000 0.000000000000000 4.594000000000000 0.000000000000000 0.000000000000000 0.000000000000000 2.959000000000000 O Ti 4 2 Direct 0.305000 0.305000 0.000000 -0.305000 -0.305000 0.000000 0.195000 0.805000 0.500000 0.805000 0.195000 0.500000 0.000000 0.000000 0.000000 0.500000 0.500000 0.500000 ! cp INCAR.relax INCAR echo "a=$i angstrom ";time vasp cp CONTCAR POSCAR cp INCAR.static INCAR echo "a=$i angstrom ";time vasp E=`grep 'TOTEN' OUTCAR | tail -1 | awk '{printf "%12.6f\n", $5}'` V=`grep 'volume' OUTCAR | tail -1 | awk '{printf "%12.4f\n", $5}'` echo $V $E >>EtVo.dat done INCAR.relax文件： SYSTEM = bulk rutile TiO2 unit cell ENCUT = 450 ISTART = 0 ICHARG = 2 ISMEAR = 1 SIGMA = 0.05 ISIF=5 IBRION = 2 NSW = 300 POTIM = 0.1 PREC = Accurate EDIFF = 1E-6 EDIFFG = 1E-4 INCAR.static文件： SYSTEM = bulk rutile TiO2 unit cell ENCUT = 450 PREC = Accurate ISTART = 0 ICHARG = 2 ISMEAR = -5 KPOINTS文件： Automatic 0 Monkhorst–Pack 5 5 8 0.0 0.0 0.0 输出的EtVo.dat: 62.4500 -53.101836 62.4500 -53.101836 62.4500 -53.101836 62.4500 -53.101836 62.4500 -53.101836 ······ |
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ljw4010: 金币+1, 谢谢交流！ 2015-03-27 20:34:25
ljw4010: 金币+1, 谢谢交流！ 2015-03-27 20:34:25
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在POSCAR需要让晶格常数成为变量，这里我只好固定一下c/a的值。 。。。。。。 rm WAVECAR for i in 4.09 4.19 4.29 4.39 4.49 4.59 4.69 4.79 4.89 4.99 5.09do cat > POSCAR <<! TiO2 1 $i 0.000000000000000 0.000000000000000 0.000000000000000 $i 0.000000000000000 0.000000000000000 0.000000000000000 $[$i*0.6441] 。。。。。。。 不过 $[$i*0.6441]这样的表达我不确定行不行，如果不行的话你可以找找linux脚本相关的资料进行修改。 |
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空谷新苗2楼2015-03-23 11:10:50
空谷新苗
木虫 (小有名气)
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