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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » P4VASP做pdos交流，及后续origin计算d-band center
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cumt蝈蝈

木虫 (正式写手)

[交流] P4VASP做pdos交流，及后续origin计算d-band center

初学p4vasp，摸索了点做pdos的方法，不知对不对，这里和大家交流交流！
一、p4vasp做pdos
1.打开p4vasp,界面如下：
P4VASP做pdos交流，及后续origin计算d-band center
2.load system，打开要处理的文件（vasp运行输出的vasprun.xml文件）
P4VASP做pdos交流，及后续origin计算d-band center-1
3.点击dos+bands的DOS图：
P4VASP做pdos交流，及后续origin计算d-band center-2
4.点击control，得到体系的结构图：
P4VASP做pdos交流，及后续origin计算d-band center-3
5.选择做pdos的表面原子，如下图：（结构图中会用阴影表示所选原子）
P4VASP做pdos交流，及后续origin计算d-band center-4
6.选择Electronic下拉菜单中的local dos + bands control，出现如下对话框：
P4VASP做pdos交流，及后续origin计算d-band center-5
7.安下图操作，点击Add new line，得pdos。
P4VASP做pdos交流，及后续origin计算d-band center-6
P4VASP做pdos交流，及后续origin计算d-band center-7
8.将pdos数据输出
P4VASP做pdos交流，及后续origin计算d-band center-8
9.得到的数据最后一组为Pdos。导入origin，将态密度*能量之积积分（analysis|mathematics |integrate ）,然后将态密度积分，两个积分的结果相除得d-band center。
10.如此计算得到的d-band center是否还要减去Fermi level？这个不太清楚。
补充一：
P4vasp计算出的d band center是已经减过Fermi level，详情参考：
http://p4vasp.at/index.php/docum ... -and-band-structure
In all DOS/bandstructure graphs is the energy relative to the Fermi energy - i.e. the Fermi energy on the graph is zero.
补充二：
附件是p4vasp早期版本的手册。补充三：
建QQ群131143427，欢迎加群讨论！

[ Last edited by cumt蝈蝈 on 2013-11-8 at 22:09 ]
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    • 2013-10-28 18:03:20, 175.09 K

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1楼 2013-09-21 00:06:00
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

cumt蝈蝈

木虫 (正式写手)
引用回帖:
22楼: Originally posted by 490105179 at 2013-11-03 20:44:54
试过了，不加新线时的数据跟加了后的第一组数据一样，我想问一下，作图时选用哪一组数据？还是要两组数据之和？...

没加线时有后一组？？后一组数据是新加的，用这组数据。
赞一下(1人) 回复此楼
23楼2013-11-04 09:20:22
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普通回帖

卡崔娜

新虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
cumt蝈蝈: 金币+5, 谢谢支持~ 2013-09-21 09:44:57
鉴于你写的这认真，顶一个

[ 发自小木虫客户端 ]
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cumt蝈蝈
2楼2013-09-21 00:31:25
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漫天飘雪

版主 (知名作家)
我也帮忙顶一个
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3楼2013-09-21 09:09:24
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zuocuiping

木虫 (职业作家)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
cumt蝈蝈: 金币+5, 多谢交流！ 2013-09-21 09:45:46
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流 2013-10-28 21:38:06
直接输入元素符号
就行了
如果花哪个原子的态密度
就输入原子序号
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4楼2013-09-21 09:11:16
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cumt蝈蝈

木虫 (正式写手)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by 卡崔娜 at 2013-09-21 00:31:25
鉴于你写的这认真，顶一个

谢谢了！
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5楼2013-09-21 09:43:50
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cumt蝈蝈

木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 漫天飘雪 at 2013-09-21 09:09:24
我也帮忙顶一个

谢谢~
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6楼2013-09-21 09:46:30
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cumt蝈蝈

木虫 (正式写手)
p4vasp官网http://p4vasp.at/
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7楼2013-09-21 11:06:32
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甲斐之虎

银虫 (正式写手)
好贴！顶一个！
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8楼2013-10-07 16:20:37
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cumt蝈蝈

木虫 (正式写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 甲斐之虎 at 2013-10-07 16:20:37
好贴！顶一个！

希望能多多交流！
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9楼2013-10-08 00:55:37
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甲斐之虎

银虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
仔细阅读了蝈蝈大哥的教程，自己也试了一下，非常好用，但是关于这一段
“将态密度*能量之积积分（analysis|mathematics |integrate ）,然后将态密度积分，两个积分的结果相除得d-band center。”
这一段时什么意思呢？d-band center是什么意思？还请蝈蝈大哥指教
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11楼2013-10-27 16:03:35
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yangmomi

金虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
之前我也尝试着这样处理过，我不知道你的处理结果值是负值还是正值。我后来是用脚本处理的
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12楼2013-10-27 20:30:22
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cumt蝈蝈

木虫 (正式写手)
引用回帖:
12楼: Originally posted by yangmomi at 2013-10-27 20:30:22
之前我也尝试着这样处理过，我不知道你的处理结果值是负值还是正值。我后来是用脚本处理的

我处理的是负的
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14楼2013-10-28 08:59:57
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yangmomi

金虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
cumt蝈蝈: 金币+5 2013-10-28 18:11:39
我也处理了一下，和脚本处理的结果差不多
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15楼2013-10-28 09:08:40
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cumt蝈蝈

木虫 (正式写手)
引用回帖:
15楼: Originally posted by yangmomi at 2013-10-28 09:08:40
我也处理了一下，和脚本处理的结果差不多

当时开始接触算d band center 时，脚本程序不会调试，就自己摸索了这个软件，后来还有点担心自己处理的不对，现在你验证过了，也可以放心的去用了！
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16楼2013-10-28 17:01:11
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cumt蝈蝈

木虫 (正式写手)
★ ★
franch: 金币+2, 鼓励交流。 2013-11-04 17:26:01
引用回帖:
11楼: Originally posted by 甲斐之虎 at 2013-10-27 16:03:35
仔细阅读了蝈蝈大哥的教程，自己也试了一下，非常好用，但是关于这一段
“将态密度*能量之积积分（analysis|mathematics |integrate ）,然后将态密度积分，两个积分的结果相除得d-band center。”
这一段时什么意 ...

d band center 的计算公式：
P4VASP做pdos交流，及后续origin计算d-band center-9
可参考：http://gilgamesh.cheme.cmu.edu/d ... -projected-dos.html
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17楼2013-10-28 18:32:39
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490105179

木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
你好，我按照你贴出的步骤，但是一直导不出数据，http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=6564108
这是我的求助帖子，请问这该怎么解决？
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18楼2013-11-03 12:15:40
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cumt蝈蝈

木虫 (正式写手)
引用回帖:
18楼: Originally posted by 490105179 at 2013-11-03 12:15:40
你好，我按照你贴出的步骤，但是一直导不出数据，http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=6564108
这是我的求助帖子，请问这该怎么解决？

已在求助帖回复，希望能帮到你。
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19楼2013-11-03 12:27:24
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490105179

木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
当选择Add new line 时，P4VASP做pdos交流，及后续origin计算d-band center-10
输出的数据有两组，请问该如何选择呢？还是两个相加？
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20楼2013-11-03 19:07:00
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cumt蝈蝈

木虫 (正式写手)
★ ★
franch: 金币+2, 鼓励交流。 2013-11-04 17:26:22
引用回帖:
20楼: Originally posted by 490105179 at 2013-11-03 19:07:00
当选择Add new line 时，
输出的数据有两组，请问该如何选择呢？还是两个相加？

下面一组数据是新加的，前面一组是已有线的数据。你可以不加新线，单独导出原有的线验证一下。
赞一下 回复此楼
21楼2013-11-03 20:38:32
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490105179

木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
21楼: Originally posted by cumt蝈蝈 at 2013-11-03 20:38:32
下面一组数据是新加的，前面一组是已有线的数据。你可以不加新线，单独导出原有的线验证一下。...

试过了，不加新线时的数据跟加了后的第一组数据一样，我想问一下，作图时选用哪一组数据？还是要两组数据之和？
赞一下 回复此楼
22楼2013-11-03 20:44:54
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490105179

木虫 (正式写手)
引用回帖:
23楼: Originally posted by cumt蝈蝈 at 2013-11-04 09:20:22
没加线时有后一组？？后一组数据是新加的，用这组数据。...

知道了，非常感谢
回复此楼
24楼2013-11-04 09:30:02
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Brilliantly

捐助贵宾 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
送红花一朵
解决了我的一个问题，果断给朵小红花，非常感谢！
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25楼2015-01-06 11:45:25
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lujinhui396

铁虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
请问，为什么用d-band center 计算为负值？如果在origin里得到两个积分的比值，应为正值啊？
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26楼2015-06-08 21:46:38
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yarlane

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
12楼: Originally posted by yangmomi at 2013-10-27 20:30:22
之前我也尝试着这样处理过，我不知道你的处理结果值是负值还是正值。我后来是用脚本处理的

请问您脚本是哪里来的？
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27楼2015-06-30 20:30:05
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monkeylove

木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
我想问一下你有没有遇到过添加线添加不上去啊
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28楼2015-09-13 12:21:12
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取名字真心难

木虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
能不能求楼主给我传一份能用的window版的p4vasp啊，我下的好像用不了。。。
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29楼2015-11-26 13:46:57
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tsglss

铁杆木虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
学习了，不懂的的请教你

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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31楼2017-05-02 14:57:23
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snn1987310

金虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
Thanks for sharing! It helps a lot!
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32楼2017-07-13 06:36:43
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为了我的DFT

铜虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
送红花一朵
请问用Origin算计这两个积分时具体是怎样设置的？
在计算能量与态密度的乘积积分，是否是先将两列数据先相乘得积，将积设置为Y,能量设置为X进行积分？
在计算态密度的积分时，是将态密度设置为Y，能量设置为X进行积分的么？
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33楼2017-12-21 20:14:32
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0506nan

木虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
楼主你好！ 导入origin，将态密度*能量之积积分（analysis|mathematics |integrate ）,然后将态密度积分，两个积分的结果相除得d-band center。将态密度积分在origin里怎么操作？谢谢~
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34楼2019-01-02 18:49:35
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dlutboy

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
你好楼主，我想问一下，在画图的时候能不能改变这个图的横坐标。
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35楼2020-02-18 22:45:38
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简单回复
甲斐之虎10楼
2013-10-08 10:29   回复  
引用回帖:
9楼: Originally posted by cumt蝈蝈 at 2013-10-08 00:55:37 希望能多多交流！...

sg1840892613楼
2013-10-27 22:48   回复  
sixiangzhe1430楼
2017-05-02 09:47   回复  
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