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cumt蝈蝈

木虫 (正式写手)


[交流] P4VASP做pdos交流,及后续origin计算d-band center

初学p4vasp,摸索了点做pdos的方法,不知对不对,这里和大家交流交流!
一、p4vasp做pdos
1.打开p4vasp,界面如下:
P4VASP做pdos交流,及后续origin计算d-band center
2.load system,打开要处理的文件(vasp运行输出的vasprun.xml文件)
P4VASP做pdos交流,及后续origin计算d-band center-1
3.点击dos+bands的DOS图:
P4VASP做pdos交流,及后续origin计算d-band center-2
4.点击control,得到体系的结构图:
P4VASP做pdos交流,及后续origin计算d-band center-3
5.选择做pdos的表面原子,如下图:(结构图中会用阴影表示所选原子)
P4VASP做pdos交流,及后续origin计算d-band center-4
6.选择Electronic下拉菜单中的local dos + bands control,出现如下对话框:
P4VASP做pdos交流,及后续origin计算d-band center-5
7.安下图操作,点击Add new line,得pdos。
P4VASP做pdos交流,及后续origin计算d-band center-6
P4VASP做pdos交流,及后续origin计算d-band center-7
8.将pdos数据输出
P4VASP做pdos交流,及后续origin计算d-band center-8
9.得到的数据最后一组为Pdos。导入origin,将态密度*能量之积积分(analysis|mathematics |integrate ),然后将态密度积分,两个积分的结果相除得d-band center。
10.如此计算得到的d-band center是否还要减去Fermi level?这个不太清楚。
补充一:
P4vasp计算出的d band center是已经减过Fermi level,详情参考:
http://p4vasp.at/index.php/docum ... -and-band-structure
In all DOS/bandstructure graphs is the energy relative to the Fermi energy - i.e. the Fermi energy on the graph is zero.
补充二:
附件是p4vasp早期版本的手册。补充三:
建QQ群131143427,欢迎加群讨论!

[ Last edited by cumt蝈蝈 on 2013-11-8 at 22:09 ]
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  • 2013-10-28 18:03:20, 175.09 K

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cumt蝈蝈

木虫 (正式写手)


引用回帖:
22楼: Originally posted by 490105179 at 2013-11-03 20:44:54
试过了,不加新线时的数据跟加了后的第一组数据一样,我想问一下,作图时选用哪一组数据?还是要两组数据之和?...

没加线时有后一组??后一组数据是新加的,用这组数据。
23楼2013-11-04 09:20:22
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普通回帖

卡崔娜

新虫 (小有名气)


★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
cumt蝈蝈: 金币+5, 谢谢支持~ 2013-09-21 09:44:57
鉴于你写的这认真,顶一个

[ 发自小木虫客户端 ]

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2013-09-21 00:31:25
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我也帮忙顶一个
3楼2013-09-21 09:09:24
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zuocuiping

木虫 (职业作家)


★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
cumt蝈蝈: 金币+5, 多谢交流! 2013-09-21 09:45:46
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流 2013-10-28 21:38:06
直接输入元素符号
就行了
如果花哪个原子的态密度
就输入原子序号
4楼2013-09-21 09:11:16
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cumt蝈蝈

木虫 (正式写手)


送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by 卡崔娜 at 2013-09-21 00:31:25
鉴于你写的这认真,顶一个

谢谢了!
5楼2013-09-21 09:43:50
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cumt蝈蝈

木虫 (正式写手)


引用回帖:
3楼: Originally posted by 漫天飘雪 at 2013-09-21 09:09:24
我也帮忙顶一个

谢谢~
6楼2013-09-21 09:46:30
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cumt蝈蝈

木虫 (正式写手)


7楼2013-09-21 11:06:32
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甲斐之虎

银虫 (正式写手)


好贴!顶一个!
8楼2013-10-07 16:20:37
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cumt蝈蝈

木虫 (正式写手)


引用回帖:
8楼: Originally posted by 甲斐之虎 at 2013-10-07 16:20:37
好贴!顶一个!

希望能多多交流!
9楼2013-10-08 00:55:37
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甲斐之虎

银虫 (正式写手)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
仔细阅读了蝈蝈大哥的教程,自己也试了一下,非常好用,但是关于这一段
“将态密度*能量之积积分(analysis|mathematics |integrate ),然后将态密度积分,两个积分的结果相除得d-band center。”
这一段时什么意思呢?d-band center是什么意思?还请蝈蝈大哥指教
11楼2013-10-27 16:03:35
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yangmomi

金虫 (小有名气)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
之前我也尝试着这样处理过,我不知道你的处理结果值是负值还是正值。我后来是用脚本处理的
12楼2013-10-27 20:30:22
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cumt蝈蝈

木虫 (正式写手)


引用回帖:
12楼: Originally posted by yangmomi at 2013-10-27 20:30:22
之前我也尝试着这样处理过,我不知道你的处理结果值是负值还是正值。我后来是用脚本处理的

我处理的是负的
14楼2013-10-28 08:59:57
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yangmomi

金虫 (小有名气)


★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
cumt蝈蝈: 金币+5 2013-10-28 18:11:39
我也处理了一下,和脚本处理的结果差不多
15楼2013-10-28 09:08:40
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cumt蝈蝈

木虫 (正式写手)


引用回帖:
15楼: Originally posted by yangmomi at 2013-10-28 09:08:40
我也处理了一下,和脚本处理的结果差不多

当时开始接触算d band center 时,脚本程序不会调试,就自己摸索了这个软件,后来还有点担心自己处理的不对,现在你验证过了,也可以放心的去用了!
16楼2013-10-28 17:01:11
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cumt蝈蝈

木虫 (正式写手)


★ ★
franch: 金币+2, 鼓励交流。 2013-11-04 17:26:01
引用回帖:
11楼: Originally posted by 甲斐之虎 at 2013-10-27 16:03:35
仔细阅读了蝈蝈大哥的教程,自己也试了一下,非常好用,但是关于这一段
“将态密度*能量之积积分(analysis|mathematics |integrate ),然后将态密度积分,两个积分的结果相除得d-band center。”
这一段时什么意 ...

d band center 的计算公式:
P4VASP做pdos交流,及后续origin计算d-band center-9
可参考:http://gilgamesh.cheme.cmu.edu/d ... -projected-dos.html
17楼2013-10-28 18:32:39
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490105179

木虫 (正式写手)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
你好,我按照你贴出的步骤,但是一直导不出数据,http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=6564108
这是我的求助帖子,请问这该怎么解决?
18楼2013-11-03 12:15:40
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cumt蝈蝈

木虫 (正式写手)


引用回帖:
18楼: Originally posted by 490105179 at 2013-11-03 12:15:40
你好,我按照你贴出的步骤,但是一直导不出数据,http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=6564108
这是我的求助帖子,请问这该怎么解决?

已在求助帖回复,希望能帮到你。
19楼2013-11-03 12:27:24
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490105179

木虫 (正式写手)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
当选择Add new line 时,P4VASP做pdos交流,及后续origin计算d-band center-10
输出的数据有两组,请问该如何选择呢?还是两个相加?
20楼2013-11-03 19:07:00
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cumt蝈蝈

木虫 (正式写手)


★ ★
franch: 金币+2, 鼓励交流。 2013-11-04 17:26:22
引用回帖:
20楼: Originally posted by 490105179 at 2013-11-03 19:07:00
当选择Add new line 时,
输出的数据有两组,请问该如何选择呢?还是两个相加?

下面一组数据是新加的,前面一组是已有线的数据。你可以不加新线,单独导出原有的线验证一下。
21楼2013-11-03 20:38:32
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490105179

木虫 (正式写手)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
21楼: Originally posted by cumt蝈蝈 at 2013-11-03 20:38:32
下面一组数据是新加的,前面一组是已有线的数据。你可以不加新线,单独导出原有的线验证一下。...

试过了,不加新线时的数据跟加了后的第一组数据一样,我想问一下,作图时选用哪一组数据?还是要两组数据之和?
22楼2013-11-03 20:44:54
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490105179

木虫 (正式写手)


引用回帖:
23楼: Originally posted by cumt蝈蝈 at 2013-11-04 09:20:22
没加线时有后一组??后一组数据是新加的,用这组数据。...

知道了,非常感谢
24楼2013-11-04 09:30:02
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Brilliantly

捐助贵宾 (正式写手)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
送红花一朵
解决了我的一个问题,果断给朵小红花,非常感谢!
25楼2015-01-06 11:45:25
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lujinhui396

铁虫 (初入文坛)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
请问,为什么用d-band center 计算为负值?如果在origin里得到两个积分的比值,应为正值啊?
26楼2015-06-08 21:46:38
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yarlane

新虫 (初入文坛)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
12楼: Originally posted by yangmomi at 2013-10-27 20:30:22
之前我也尝试着这样处理过,我不知道你的处理结果值是负值还是正值。我后来是用脚本处理的

请问您脚本是哪里来的?
27楼2015-06-30 20:30:05
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monkeylove

木虫 (正式写手)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
我想问一下你有没有遇到过添加线添加不上去啊
28楼2015-09-13 12:21:12
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取名字真心难

木虫 (初入文坛)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
能不能求楼主给我传一份能用的window版的p4vasp啊,我下的好像用不了。。。
29楼2015-11-26 13:46:57
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tsglss

铁杆木虫 (著名写手)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
学习了,不懂的的请教你

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
31楼2017-05-02 14:57:23
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snn1987310

金虫 (小有名气)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
Thanks for sharing! It helps a lot!
32楼2017-07-13 06:36:43
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为了我的DFT

铜虫 (初入文坛)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
送红花一朵
请问用Origin算计这两个积分时具体是怎样设置的?
在计算能量与态密度的乘积积分,是否是先将两列数据先相乘得积,将积设置为Y,能量设置为X进行积分?
在计算态密度的积分时,是将态密度设置为Y,能量设置为X进行积分的么?
33楼2017-12-21 20:14:32
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0506nan

木虫 (小有名气)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
楼主你好! 导入origin,将态密度*能量之积积分(analysis|mathematics |integrate ),然后将态密度积分,两个积分的结果相除得d-band center。将态密度积分在origin里怎么操作?谢谢~
34楼2019-01-02 18:49:35
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dlutboy

新虫 (初入文坛)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
你好楼主,我想问一下,在画图的时候能不能改变这个图的横坐标。
35楼2020-02-18 22:45:38
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简单回复
2013-10-08 10:29   回复  
引用回帖:
9楼: Originally posted by cumt蝈蝈 at 2013-10-08 00:55:37 希望能多多交流!...

sg1840892613楼
2013-10-27 22:48   回复  
2017-05-02 09:47   回复  
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