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求助向NCBI提交放线菌全基因组序列
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maoxixi
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专业: 微生物生理与生物化学
[
求助
]
求助向NCBI提交放线菌全基因组序列
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向NCBI提交的全基因组序列必须拼接完全吗?我们的序列是拼接成scaffold的形式的中间有很多gap可以提交到NCBI吗?还是只能上传测序时分析好的能翻译的基因?急求,谢啦!!!
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1楼
2015-03-14 11:20:11
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紫煜紫煜紫煜
新虫
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注册: 2012-12-13
专业: 植物病理学
楼主你现在提交好你的序列了吗??我想问序列除了序列,还需要什么,组装的信息需要吗??只有用何种方式测序就可以吗?不懂,求解
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5楼
2015-04-01 15:56:59
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zct2008
至尊木虫
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专业: 微生物生理与生物化学
可以的,有gap没关系的,可以向GenBank提交
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天行健,君子以自强不息;地势坤,君子以厚德载物。
2楼
2015-03-15 09:57:35
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zct2008
至尊木虫
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专业: 微生物生理与生物化学
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
maoxixi: 金币+15,
★★★
很有帮助
2015-03-16 11:29:32
可以的,有gap没关系的,可以向GenBank提交
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天行健,君子以自强不息;地势坤,君子以厚德载物。
3楼
2015-03-15 09:58:00
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nanhu1984
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注册: 2013-07-04
专业: 病原细菌、细菌感染与宿主
可以提交的,你可以利用NCBI的自动注释系统注释基因之后再提交,可以参考
http://www.microbialgenomic.com/
细菌基因组分析知识普及.html
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https://www.microbialgenomic.cn/
4楼
2015-03-21 10:51:38
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