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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 综合其他 » 求助向NCBI提交放线菌全基因组序列
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maoxixi

新虫 (初入文坛)

[求助] 求助向NCBI提交放线菌全基因组序列 已有1人参与

向NCBI提交的全基因组序列必须拼接完全吗？我们的序列是拼接成scaffold的形式的中间有很多gap可以提交到NCBI吗？还是只能上传测序时分析好的能翻译的基因？急求，谢啦！！！
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1楼 2015-03-14 11:20:11
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zct2008

至尊木虫 (著名写手)
可以的，有gap没关系的，可以向GenBank提交
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天行健，君子以自强不息；地势坤，君子以厚德载物。
2楼2015-03-15 09:57:35
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zct2008

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
maoxixi: 金币+15, ★★★很有帮助 2015-03-16 11:29:32
可以的，有gap没关系的，可以向GenBank提交
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天行健，君子以自强不息；地势坤，君子以厚德载物。
3楼2015-03-15 09:58:00
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nanhu1984

银虫 (正式写手)
可以提交的，你可以利用NCBI的自动注释系统注释基因之后再提交，可以参考http://www.microbialgenomic.com/细菌基因组分析知识普及.html
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https://www.microbialgenomic.cn/
4楼2015-03-21 10:51:38
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紫煜紫煜紫煜

新虫 (初入文坛)
楼主你现在提交好你的序列了吗？？我想问序列除了序列，还需要什么，组装的信息需要吗？？只有用何种方式测序就可以吗？不懂，求解
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5楼2015-04-01 15:56:59
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