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maoxixi

新虫 (初入文坛)

[求助] 求助向NCBI提交放线菌全基因组序列 已有1人参与

向NCBI提交的全基因组序列必须拼接完全吗?我们的序列是拼接成scaffold的形式的中间有很多gap可以提交到NCBI吗?还是只能上传测序时分析好的能翻译的基因?急求,谢啦!!!
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zct2008

至尊木虫 (著名写手)

可以的,有gap没关系的,可以向GenBank提交
天行健,君子以自强不息;地势坤,君子以厚德载物。
2楼2015-03-15 09:57:35
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zct2008

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
maoxixi: 金币+15, ★★★很有帮助 2015-03-16 11:29:32
可以的,有gap没关系的,可以向GenBank提交
天行健,君子以自强不息;地势坤,君子以厚德载物。
3楼2015-03-15 09:58:00
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nanhu1984

银虫 (正式写手)

可以提交的,你可以利用NCBI的自动注释系统注释基因之后再提交,可以参考http://www.microbialgenomic.com/细菌基因组分析知识普及.html
https://www.microbialgenomic.cn/
4楼2015-03-21 10:51:38
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紫煜紫煜紫煜

新虫 (初入文坛)

楼主你现在提交好你的序列了吗??我想问序列除了序列,还需要什么,组装的信息需要吗??只有用何种方式测序就可以吗?不懂,求解
5楼2015-04-01 15:56:59
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