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[求助]
活性中心含金属的酶的参数设置
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| 按照生物分子模拟论坛中版主的教程http://bioms.org/forum.php?mod=viewthread&tid=381，使用autodock4.2进行含钼酶1FIQ和Febuxostat的对接，对接很成功，但是有一个疑惑，手工修改pdbqt文件中金属的电荷，这个电荷怎样确定呢？我改成了原电荷，就是把Mo设置成了6.00，这样设置对吗？我是个新手不太懂，但是看别的电荷并不是这个原子的原电荷，还有我的dlg中Ki值竟达到了am级别，报道中这个化合物的ki的单位为nm,深深的忧虑，不知道怎样确定电荷，查别人对接的文章里又都不提及这一问题，向大家求助，帮帮我吧，金币不多，感激不禁。 |
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