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Dmol3如何实现沿某一方向优化晶包
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Dmol3如何实现沿某一方向优化晶包
问题如上,在MS中的Dmol3模块优化晶包结构,想固定a、b两方向只优化c方向,并且固定αβγ三个角度,我是这样做的:在“Modify--Constraints--Lattice”中勾选了“a、b、α、β、γ”,c没有勾选,如下图。
结果优化过程中发现“a、b、c、α、β、γ”几个量都在发生变化,也就是说根本没有达到固定其他方向只沿c方向优化的目的。
请问大家有谁了解该如何实现吗?先谢了,,,
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2015-02-03 20:28:27
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2015-02-05 15:59:23
DMol3即便能够固定某些方向的来进行优化结构我也不建议使用,这种方法我自己做了测试,不同的收敛精度晶格常数的结果差别很大。
如果只有一个方向,那么可以对这个晶格方向多设定几个值进行固定晶格的优化,然后通过抛物线或三次方曲线插值到能量极值点,这样应该好一些。
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2015-02-04 13:43:44
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卡开发发
at 2015-02-04 13:43:44
DMol3即便能够固定某些方向的来进行优化结构我也不建议使用,这种方法我自己做了测试,不同的收敛精度晶格常数的结果差别很大。
如果只有一个方向,那么可以对这个晶格方向多设定几个值进行固定晶格的优化,然后 ...
首先非常感谢你的建议,还有两个问题:
(1)我的是个一维纳米管结构,如果三个方向一块优化(其实ab两方向优化没意义)还会出现你说的那种情况吗(不同精度结果差别较大)?
(2)你所说的这个方法就是设定几个值进行固定晶格优化,然后用抛物线拟合曲线并找出拟合曲线的极值点吗?
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3楼
2015-02-04 15:59:34
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小虫_sang
at 2015-02-04 15:59:34
首先非常感谢你的建议,还有两个问题:
(1)我的是个一维纳米管结构,如果三个方向一块优化(其实ab两方向优化没意义)还会出现你说的那种情况吗(不同精度结果差别较大)?
(2)你所说的这个方法就是设定几个 ...
1、不加上色散校正不清楚,加上色散校正a,b两方向上可能会导致相邻两个晶格的纳米管距离小于vdw距离,所以还是不要这样,即便能够固定a和b,c方向上的结果也不太好,所以建议是不要用直接opt cell的方案;
2、是的,这也是比较常用的方法。
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2015-02-04 16:14:16
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4楼
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卡开发发
at 2015-02-04 16:14:16
1、不加上色散校正不清楚,加上色散校正a,b两方向上可能会导致相邻两个晶格的纳米管距离小于vdw距离,所以还是不要这样,即便能够固定a和b,c方向上的结果也不太好,所以建议是不要用直接opt cell的方案;
2、是的 ...
非常感谢
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2015-02-04 21:06:15
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