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落雨辰砂

金虫 (小有名气)

[求助] dmol3吸附优化不收敛

小弟在做NIMOS硫催化剂加氢吸附模拟是，给已优化好了的NIMOS上加氢后（分别采取了add atoms和将已优化好了的H2直接粘贴在NIMOS晶胞中两种方法）..再进行结构优化时，总失败（如下） 为啥失败及如何修改求大虾指点一二....以及在进行dmol3吸附模拟时，关于参数设置也希望给予点拨 不甚感激..
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1楼 2012-03-11 14:39:37
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o58285880

银虫 (小有名气)
分子到底物的距离是不是太近了  放远点 ~那么近  底物会塌陷的。 起码2A成键距离   超过5A 没作用 距离最好 2-5A
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。。。。。。
2楼2012-03-12 23:42:24
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o58285880

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong(金币+2): 鼓励交流 2012-03-13 07:58:26
落雨辰砂(金币+10): ★有帮助 2012-03-13 09:32:31
貌似底物都有问题  不知道是切面有问题，还是导入的时候被你删掉原子了。。实在不行 Q我吧 58285880
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。。。。。。
3楼2012-03-12 23:45:10
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落雨辰砂

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by o58285880 at 2012-03-12 23:45:10:
貌似底物都有问题  不知道是切面有问题，还是导入的时候被你删掉原子了。。实在不行 Q我吧 58285880

底物的结构是他人构建的，优化计算也可以收敛，我也不确定是否有问题，先更改一下H2的距离，再计算看看..总之还是谢谢了
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4楼2012-03-13 09:34:39
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