| 查看: 4809 | 回复: 8 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
stevenlee8356银虫 (正式写手)
|
[求助]
NCBI提交基因组序列，工作人员回信，大家看看是什么意思，谢谢啦！！！！ 已有1人参与
|
|
|
前段时间给NCBI提交了一段全基因组序列，过了几天工作人员给回信过来，大家看看下面的回信是什么意思，谢谢啦！！！！ Dear XXXXX, Thank you for your Lactobacillus plantrum NMR-5 genome submission. Before we can assign your accession number, there are a few issues that require your attention: [1] This appears to be a complete and circularized genome. Please let us know if this is not the case. [2] If you do not plan to submit your own annotation, we would like to run your complete unannotated genome and plasmid through the NCBI prokaryotic annotation pipeline. Having annotation on the complete bacterial genomes is very useful to the scientific community. [3] If you would like us to annotate your genome, please let us know if you would like to review the data or for us to release the annotation without your review. [4] Have you registered a genome project and BioSample for your genomes? If you have, please provide the ID numbers that were returned. If you have not, please register your genome and locus_tag prefix at: https://submit.ncbi.nlm.nih.gov/subs/bioproject/ Register your BioSample at: https://submit.ncbi.nlm.nih.gov/subs/biosample/ [5] Please provide the following information: --coverage (if appropriate) --Was this assembly based on a reference genome? If so, please provide the accession number for the reference genome that was used. [6] It has been brought to our attention that it can be extremely difficult to find the source DNA/bacteria for many of the bacteria for which there are complete genomes. Sometimes the submitting centers are not the ones who have the source DNA or bacteria strain. In light of this difficulty, we are now asking submitters to provide DNA/bacteria source information to us. A single line is satisfactory-- 'Source DNA is available from....'; 'Bacteria available from...', where a name and email address or culture collection information is given. Please let us know if you have any questions about these comments. Sincerely, Leigh ******************************************************************* Leigh A. Riley, Ph.D. The GenBank Direct Submission Staff Bethesda, Maryland USA !!!Please send all .sqn files to us using: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/proj ... t/genome_submit.cgi !!! genomes@ncbi.nlm.nih.gov (for updates/replies to GenBank entries) info@ncbi.nlm.nih.gov (for general questions regarding GenBank) ******************************************************************* |
回复此楼» 猜你喜欢
Wnt-C59：PORCN靶向化学探针，Wnt信号通路阻断机制与科研应用全解析
已经有0人回复
-
Fexaramine：肠道限制性FXR化学探针，结构特征与信号通路研究全解析
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有126人回复
-
NVS-STG2：靶向STING跨膜域的分子胶类激动剂，结构特征与寡聚化机制研究全解析
已经有0人回复
-
DOTA-GPC3肽（CAS 3066439-94-6）：双功能分子探针前体的结构特征与标记应用解析
已经有0人回复
-
科研用 TLR7/8 双激动剂怎么选？现货与质控要点
已经有0人回复
-
SEL120-34A HCl：CDK8/CDK19高选择性激酶抑制剂
已经有0人回复
-
氢氧化钾活化操作
已经有18人回复
-
散金
已经有68人回复
-
生物质超级电容器
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 求助：NCBI提交序列问题
已经有5人回复
- 求助：如何批量获得基因的序列号
已经有4人回复
- 怎样在NCBI上查找基因的cDNA序列
已经有14人回复
- NCBI 上传序列后 系统也没回复，写信也不回
已经有14人回复
- ncbi序列比对结果显示灰色小写字母
已经有9人回复
- 如何用NCBI查找一段基因序列的启动子？
已经有11人回复
- NCBI中的蛋白序列与基因序列不对应
已经有3人回复
- 在NCBI里搜索到a基因多条序列，如何确定该基因的序列？
已经有9人回复
- 递交新序列到NCBI遇到的问题求解惑。
已经有4人回复
- 如何从NCBI下载基因组序列
已经有299人回复
- GenBank 上提交新基因的氨基酸序列 一般需要多久才能录进NCBI数据库上
已经有11人回复
- 想要设计引物 可是NCBI中blast后只有蛋白序列 如何得到基因序列 谢谢啊
已经有15人回复
- 【求助/交流】求融合基因FIP1L1-PDGFRA在NCBI里基因完整序列的登录号
已经有5人回复
- 怎样根据下列条件在NCBI上搜索到基因序列的全长
已经有4人回复
- 菜鸟求助——着急求助解答：在NCBI上为什么下载不了FASTA格式的基因序列
已经有9人回复
- 请问如何向NCBI提交全基因组序列？
已经有9人回复
- 如何在ncbi上提交序列获得序列登记号
已经有5人回复
- 【求助/交流】NCBI上注册基因序列，没有ACCESSION NUMEBER是怎么回事？谢谢
已经有6人回复
stevenlee8356
银虫 (正式写手)
- 应助: 6 (幼儿园)
- 金币: 876.3
- 散金: 4
- 红花: 4
- 帖子: 723
- 在线: 166.4小时
- 虫号: 739394
- 注册: 2009-04-03
- 性别: GG
- 专业: 食品科学基础
7楼2015-05-20 12:00:43
DNA药物
金虫 (著名写手)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 3479.8
- 散金: 161
- 红花: 2
- 帖子: 1762
- 在线: 349.7小时
- 虫号: 940564
- 注册: 2010-01-11
- 性别: GG
- 专业: 生物化工与食品化工
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
stevenlee8356: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 谢谢啊，回答的很全面 2015-01-29 16:05:57
感谢参与，应助指数 +1
stevenlee8356: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 谢谢啊，回答的很全面 2015-01-29 16:05:57
|
【1】你提交的可能是环状的基因组序列，如果不是，你要及时通知我们 【2】如果你不打算注释你提交的序列，我们将帮你注释，注释后的基因组信息是一个非常有用的科研工具。 【3】如果你让我们来注释基因组信息，请告知我们你是否要核查注释后的数据信息或者我们注释后就直接将信息披露出去 【4】你以前为你的基因组提交过相应的生物样品吗？如果有，请告知我们当时我们返给你的ID号。注：你的基因组是新的，那么所对应的生物样品也该是未曾在NCBI上登记的，所以要登记下。 【5】请提供相关信息：1.完整度2你提供的序列信息是否由相关序列组装起来的，如果是，请提交那些序列的登录号 总之，你要让别人相信你提交的数据，你要提供更详细的信息，对其进行注释或由他们注释，其次你要提供该基因组信息的DNA来源，如哪一种菌株等！！！GOOD LUCK! |
2楼2015-01-29 13:06:41
3楼2015-03-09 11:34:03
stevenlee8356
银虫 (正式写手)
- 应助: 6 (幼儿园)
- 金币: 876.3
- 散金: 4
- 红花: 4
- 帖子: 723
- 在线: 166.4小时
- 虫号: 739394
- 注册: 2009-04-03
- 性别: GG
- 专业: 食品科学基础
4楼2015-03-09 22:24:19
投票:
30