[交流] 在ncbi上下载的分子在autodock中打开就报错，用sybyl搭建的也报错 已有3人参与

各位大神们，想请教一个问题。我在ncbi上下载的小分子sdf文件，然后用pymol直接另存为pdb文件，用autodock打开时就报错。之后我又自己用sybyl直接搭建了一个小分子结构，保存为pdb结构，也报错。不知道各位知不知道有什么方法能够解决这个问题，不胜感激！报错的内容如上传的图片所示，谢谢各位了！ 还有一个想请教的问题，我们有一个酶，它的底物也是大分子的蛋白，我们做了这个酶的一些删除突变体，在体外检测了突变体与底物的相互作用，我们想用分子模拟的方法看看删除突变后，酶和底物的相互作用出现了什么变化，不知道有什么比较简单方便的软件能够完成这项工作，各位能否推荐一下呢？感激不尽！ 捕获.PNG

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