[交流] 在ncbi上下载的分子在autodock中打开就报错，用sybyl搭建的也报错 已有3人参与

各位大神们，想请教一个问题。我在ncbi上下载的小分子sdf文件，然后用pymol直接另存为pdb文件，用autodock打开时就报错。之后我又自己用sybyl直接搭建了一个小分子结构，保存为pdb结构，也报错。不知道各位知不知道有什么方法能够解决这个问题，不胜感激！报错的内容如上传的图片所示，谢谢各位了！ 还有一个想请教的问题，我们有一个酶，它的底物也是大分子的蛋白，我们做了这个酶的一些删除突变体，在体外检测了突变体与底物的相互作用，我们想用分子模拟的方法看看删除突变后，酶和底物的相互作用出现了什么变化，不知道有什么比较简单方便的软件能够完成这项工作，各位能否推荐一下呢？感激不尽！ 捕获.PNG

回复此楼

» 猜你喜欢

• 我面上完蛋了 已经有11人回复
• 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 已经有8人回复
• 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 已经有3人回复
• 明天应该可查了！？ 已经有5人回复
• 如果此刻你正在为国基感到焦虑，不妨来听听这首《基金之外》 已经有7人回复
• 没有任何消息-是不是就凉了 已经有8人回复
• 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 已经有3人回复
• 人气不行了 已经有10人回复
• 能否退出参与的面上项目解除限项 已经有24人回复
• filecode，4个jtjc了 已经有17人回复

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

高级回复

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

• 求助Autodock的配体里Eu原子类型不识别怎么办 已经有7人回复
• 请问有没有小分子数据库可以直接下载相关的力场参数文件的？ 已经有3人回复
• Autodock的操作流程---win下 已经有565人回复
• Autodock时 gridbox的参数怎么设置?? 已经有18人回复
• 【求助】请教DOCK 6.4安装(楼主取消求助) 已经有6人回复
• 【求助】autodock中PDB转pdbqt格式问题？ 已经有9人回复