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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 最小化时出现问题
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说好de

新虫 (小有名气)

[求助] 最小化时出现问题 已有2人参与

想请教怎么样在MS中构建氮气分子模型，氮气分子跟氧气分子是不一样的。
简单简单的两个氮原子，不能进行计算，由于初涉这一部分，所以不是很懂，求指教。谢谢。

最小化时出现问题
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加油好姑娘！
1楼 2015-01-02 18:36:35
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
说好de: 金币+4, ★★★★★最佳答案 2015-01-04 20:37:48
引用回帖:
7楼: Originally posted by 说好de at 2015-01-04 16:37:07
可是这样的话，不能进行计算吧？我想要把氮气还有有机蒸气组分比如正戊烷放在一起的话，amorphous cell中construction时是无法添加的。要怎么半呢？...

第一张图是小分子结构，你看看最右的是不是你要的效果

第二张图是设置，amorphous cell——calculation——task construction，设定各小分子需要的数量，设定目标密度，设定energy tab中的力场，charge forcefield assigned

最小化时出现问题-1

最小化时出现问题-2
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#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
10楼2015-01-04 18:34:46
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普通回帖

pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
★
说好de(月只蓝代发): 金币+1, 感谢指导 2015-01-04 10:34:25
你是怎么画模型的？用的什么力场？
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2楼2015-01-04 10:18:49
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月只蓝

主管区长 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
错误提示表明，力场和电荷分配问题。
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MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助！时间精力有限，恕不接受无偿私信求助。
3楼2015-01-04 10:35:08
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说好de

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by pigrass at 2015-01-04 10:18:49
你是怎么画模型的？用的什么力场？

因为我刚刚接触这一部分，所以就跟建立氧气分子模型一样建立的，结果就出现了这种情况。还有我看有的解释是氮气分子建立的时候需要中间添加一个虚拟的原子，是这样吗?不懂。
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加油好姑娘！
4楼2015-01-04 11:24:25
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说好de

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 月只蓝 at 2015-01-04 10:35:08
错误提示表明，力场和电荷分配问题。

那应该怎么用什么力场，还有怎样分配电荷呢？有的解释需要在氮气原子之间再添加一个虚拟原子，那虚拟原子要怎么样添加呢？真心不懂。
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加油好姑娘！
5楼2015-01-04 11:26:30
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
引用回帖:
4楼: Originally posted by 说好de at 2015-01-04 11:24:25
因为我刚刚接触这一部分，所以就跟建立氧气分子模型一样建立的，结果就出现了这种情况。还有我看有的解释是氮气分子建立的时候需要中间添加一个虚拟的原子，是这样吗?不懂。...

虚拟原子在MS里很难建
我觉得没特殊要求的话，氮气就是两个N，三键就好了
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6楼2015-01-04 13:39:26
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说好de

新虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by pigrass at 2015-01-04 13:39:26
虚拟原子在MS里很难建
我觉得没特殊要求的话，氮气就是两个N，三键就好了...

可是这样的话，不能进行计算吧？我想要把氮气还有有机蒸气组分比如正戊烷放在一起的话，amorphous cell中construction时是无法添加的。要怎么半呢？
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加油好姑娘！
7楼2015-01-04 16:37:07
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
引用回帖:
7楼: Originally posted by 说好de at 2015-01-04 16:37:07
可是这样的话，不能进行计算吧？我想要把氮气还有有机蒸气组分比如正戊烷放在一起的话，amorphous cell中construction时是无法添加的。要怎么半呢？...

我用三键氮可以建AC的啊

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8楼2015-01-04 17:40:40
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
引用回帖:
7楼: Originally posted by 说好de at 2015-01-04 16:37:07
可是这样的话，不能进行计算吧？我想要把氮气还有有机蒸气组分比如正戊烷放在一起的话，amorphous cell中construction时是无法添加的。要怎么半呢？...

氮气一个结构文件，正戊烷一个结构文件，AC建模的时候把两个结构都选进去，就行了

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9楼2015-01-04 17:46:51
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