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psi-blast使用求助
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| 您好，最近使用psi-blast时本地输入以下命令psiblast -query seq.fasta -db db -num_threads 15 -out outfile.txt -outfmt 6后得到一些结果，但是增加迭代次数参数-num_interations 2后出现警告并说Frequency ratios for PSSM are all zeros, frequency ratios for BLOSUM62 will be used during traceback in composition based statistics.为什么pssm会全部为0？是否需要加载pssm文件，如果是的话这个文件时从哪里产生的？为什么默认参数时没有这个报错?刚开始使用，不太懂，求大神指教！跪谢！ |
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