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maweisimple

铁虫 (小有名气)

[求助] 人类基因组测序 已有2人参与

一直有疑问,人类基因组测序用的是谁的样本?是同一个组织的细胞吗?需要考虑同一个体不同类型细胞的差异性吗?是测24条染色体吗?那是不是只能测男性?需要样本的种族和地域多样性吗?不过我看有些报道称第几条第几条染色体测定结束,那是不是每个承接单位只负责一个样本的某一个染色体测定呢?测序用的什么方法?为什么会耗时耗钱那么多呢?
请大家赐教!

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hydzp

木虫之王 (文学泰斗)

不懂帮顶一哈
2楼2014-11-28 08:08:40
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gaoyang636

木虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
maweisimple(myprayer代发): 金币+3, 赠人玫瑰手有余香,分子生物期待你更多精彩。 2014-11-28 12:45:59
最权威的答案可以通过最简单的方法获取,看当时的paper (Craige Venter版本):http://www.sciencemag.org/content/291/5507/1304.full

有这么一段:Celera and the IRB believed that the initial version of a completed human genome should be a composite derived from multiple donors of diverse ethnic backgrounds...(e.g., African-American, Chinese, Hispanic, Caucasian, etc.). We enrolled 21 donors ...Three basic items of information from each donor were recorded and linked by confidential code to the donated sample: age, sex, and self-designated ethnogeographic group.

组织的话,肯定主要就是血液了,总不能切块肉下来,这点在文章中也说了:From females, ~130 ml of whole, heparinized blood was collected. From males, ~130 ml of whole, heparinized blood was collected...当然还有一些精液。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

3楼2014-11-28 11:26:10
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幸福DE小指

木虫 (小有名气)

★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
maweisimple(myprayer代发): 金币+1, 赠人玫瑰手有余香,分子生物期待你更多精彩。 2014-11-28 12:46:09
建议搜一下中科院北京基因组研究所于军老师讲授的基因组学,里面设计很详细的人类基因组计划。
选择了远方,便只顾风雨兼程。
4楼2014-11-28 11:35:19
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liuderong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
从哪个人身上取的材料这个应该是保密的,查不到。第一个染色体组考虑的变数比较少,后来测序技术发展起来了才考虑地域、人种的差异,比如后来有了一个“国际千人基因组计划”。开头测序是用桑格测序法,耗时耗钱很多的,现在用高通量测序了成本才降下来。
5楼2014-11-28 13:41:00
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maweisimple

铁虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by gaoyang636 at 2014-11-28 11:26:10
最权威的答案可以通过最简单的方法获取,看当时的paper (Craige Venter版本):http://www.sciencemag.org/content/291/5507/1304.full

有这么一段:Celera and the IRB believed that the initial version of  ...

非常感谢!
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6楼2014-11-30 13:27:03
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maweisimple

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by liuderong at 2014-11-28 13:41:00
从哪个人身上取的材料这个应该是保密的,查不到。第一个染色体组考虑的变数比较少,后来测序技术发展起来了才考虑地域、人种的差异,比如后来有了一个“国际千人基因组计划”。开头测序是用桑格测序法,耗时耗钱很多 ...

谢谢谢谢!
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7楼2014-11-30 13:27:35
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ahura

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

人类基因组计划当年采用的是美国水牛城,也就是布法罗的一名白人的新鲜肝脏组织,当时这名白人出了车祸,经他同意,决定采用他的基因来进行基因组测序,但他的具体姓名及身份对外界是完全保密的。
8楼2015-09-25 00:46:27
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maweisimple

铁虫 (小有名气)

谢谢!

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9楼2015-09-25 08:07:20
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