版块导航
正在加载中...
客户端APP下载
登录
注册
帖子
帖子
用户
本版
应《网络安全法》要求,自2017年10月1日起,未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用,请尽快对帐号进行手机号验证,感谢您的理解与支持!
24小时热门版块排行榜
>
论坛更新日志
(3114)
>
文献求助
(167)
>
虫友互识
(90)
>
招聘信息布告栏
(77)
>
导师招生
(62)
>
论文投稿
(58)
>
博后之家
(43)
>
考博
(43)
>
硕博家园
(35)
>
休闲灌水
(35)
>
找工作
(23)
>
基金申请
(21)
>
教师之家
(20)
>
考研
(20)
>
绿色求助(高悬赏)
(18)
>
论文道贺祈福
(17)
小木虫论坛-学术科研互动平台
»
生物医药区
»
分子生物
»
综合其他
»
叶绿体基因组注释的几个问题
4
1/1
返回列表
查看: 3833 | 回复: 3
只看楼主
@他人
存档
新回复提醒
(忽略)
收藏
在APP中查看
Hugx
金虫
(小有名气)
应助: 0
(幼儿园)
金币: 524.3
散金: 667
帖子: 209
在线: 103.9小时
虫号: 802137
注册: 2009-07-02
性别: GG
专业: 植物分类学
[
求助
]
叶绿体基因组注释的几个问题
已有2人参与
本人初步接触叶绿体基因组,其中有几个问题想大家请教下:
1. 叶绿体基因组在DOGMA中注释完后之后如何分别提取其中蛋白质编码序列,trn基因序列等,DOGMA网站中点击“Extract Sequence”提取的似乎是该网站自动注释的相关序列,而不是手动注释过的序列。
2. 在DOGMA网站上注释的不含内含子的基因出现两段,这两段有部分重叠
,这个怎么解释啊,是序列拼接有问题吗?
3. 这种一个基因注释有重叠的怎么注释?
回复此楼
» 猜你喜欢
伊曲莫德(Etrasimod)从“肠道免疫失控”到精准靶向干预
已经有1人回复
西达本胺:创新HDAC抑制剂的抗肿瘤之路
已经有0人回复
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有179人回复
金色抗生素单硫酸卡那霉素的物化性质、制备与前景
已经有0人回复
解密度鲁特韦——新一代HIV整合酶抑制剂的化学、药理与产业化图景
已经有0人回复
左炔诺孕酮从沃氏氧化物到炔基化反应的工艺迭代与靶点解析
已经有0人回复
“关闭瘙痒信号”的多肽地非法林醋酸盐全解析
已经有1人回复
Tosylate-DPA-714介导¹⁸F-DPA-714 PET成像的前沿进展
已经有0人回复
I-BRD9: BRD9溴结构域化学探针,BET选择性>700倍
已经有0人回复
莫那利珠单抗阻断NKG2A/HLA-E抑制通路 | Biochempartner
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:
拟南芥核基因编码蛋白,定位于叶绿体。已知氨基酸序列,怎么找到前导肽?
已经有6人回复
有木有一个基因组疾病的数据库?
已经有5人回复
如何根据基因中的保守结构域在基因组中找同源基因
已经有3人回复
在NCBI上找一个基因
已经有7人回复
如何查询拟南芥中一个已知功能基因在其它种中的已鉴定的同类基因
已经有6人回复
公布的基因组没有这个基因的注释,而用其他软件发现了这个基因,如何?
已经有4人回复
烟草总DNA电泳怎么出现这个样子的条带啊?谁能解释一下,谢谢了
已经有3人回复
如何做全蛋白组的COG批量分类
已经有6人回复
已经克隆测序到了matK序列,如何界定?急切求助中,谢谢!
已经有10人回复
【求助/交流】白色体是不是像叶绿体一样也有一套可以母系遗传的质体基因组?
已经有5人回复
求助叶绿体基因组提取方法
已经有3人回复
生物信息学专题-生物版,医学版和信息科学版共同创建
已经有87人回复
成功的人不是赢在起点,而是赢在转折点。
1楼
2014-11-01 21:54:05
已阅
回复此楼
关注TA
给TA发消息
送TA红花
TA的回帖
棉花糖甜
禁虫
(小有名气)
西门吹雪170: 应助指数-1, 无应助
2014-11-25 13:21:42
本帖内容被屏蔽
2楼
2014-11-25 01:54:37
已阅
回复此楼
关注TA
给TA发消息
送TA红花
TA的回帖
nn219
新虫
(初入文坛)
应助: 0
(幼儿园)
金币: 12.5
帖子: 9
在线: 2.3小时
虫号: 2774046
注册: 2013-11-03
【答案】应助回帖
我也才刚接触,师兄说DOGMA注释的基因组必须手动修改,即用squin导入NCBI的格式手动将错误的地方改过来。但是具体怎么做我还不太清楚。
赞
一下
(1人)
回复此楼
3楼
2015-01-08 10:10:30
已阅
回复此楼
关注TA
给TA发消息
送TA红花
TA的回帖
注定的回忆
铁虫
(初入文坛)
应助: 0
(幼儿园)
金币: 437.5
帖子: 10
在线: 3.1小时
虫号: 6279723
注册: 2017-04-10
性别:
MM
专业: 生物信息学
楼主你好,请教一下你在DOGMA上注释好的序列是怎么导出来的?
赞
一下
回复此楼
4楼
2017-04-10 10:20:01
已阅
回复此楼
关注TA
给TA发消息
送TA红花
TA的回帖
相关版块跳转
新药研发
药学
药品生产
分子生物
微生物
动植物
生物科学
医学
我要订阅楼主
Hugx
的主题更新
4
1/1
返回列表
如果回帖内容含有宣传信息,请如实选中。否则帐号将被全论坛禁言
普通表情
龙
兔
虎
猫
百度网盘
|
360云盘
|
千易网盘
|
华为网盘
在新窗口页面中打开自己喜欢的网盘网站,将文件上传后,然后将下载链接复制到帖子内容中就可以了。
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭
确定