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Hugx

金虫 (小有名气)

[求助] 叶绿体基因组注释的几个问题 已有2人参与

本人初步接触叶绿体基因组,其中有几个问题想大家请教下:
1. 叶绿体基因组在DOGMA中注释完后之后如何分别提取其中蛋白质编码序列,trn基因序列等,DOGMA网站中点击“Extract Sequence”提取的似乎是该网站自动注释的相关序列,而不是手动注释过的序列。

2. 在DOGMA网站上注释的不含内含子的基因出现两段,这两段有部分重叠 \"叶绿体基因组注释的几个问题\",这个怎么解释啊,是序列拼接有问题吗?

3. 这种一个基因注释有重叠的怎么注释? \"叶绿体基因组注释的几个问题-1\"
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nn219

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

我也才刚接触,师兄说DOGMA注释的基因组必须手动修改,即用squin导入NCBI的格式手动将错误的地方改过来。但是具体怎么做我还不太清楚。
3楼2015-01-08 10:10:30
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棉花糖甜

禁虫 (小有名气)

西门吹雪170: 应助指数-1, 无应助 2014-11-25 13:21:42
本帖内容被屏蔽

2楼2014-11-25 01:54:37
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注定的回忆

铁虫 (初入文坛)

楼主你好,请教一下你在DOGMA上注释好的序列是怎么导出来的?
4楼2017-04-10 10:20:01
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