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sddtc888至尊木虫 (著名写手)
Hψ=Eψ S=klnΩ dS≥δQ/T
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[求助]
求助关于过渡态输入文件问题已有3人参与
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我要找一个过渡态，输入文件如下，但是我一运行Guassian就报错： Old curvilinear step not converged, using linear step: SCX= 7.85D+00 DXMaxT= 1.77-317 SCLim= 0.00D+00 Fact= 0.00D+00 RedCar/ORedCr failed for GTrans. Error termination via Lnk1e in /opt/g09/l101.exe at Tue Oct 21 21:39:44 2014. Job cpu time: 0 days 0 hours 1 minutes 15.0 seconds. File lengths (MBytes): RWF= 5 Int= 0 D2E= 0 Chk= 1 Scr= 1 求助怎么办？是不是我初始结构没设置好？还有关于原子顺序必需一致，我已经做到一致了（我用gview分别画了初始结构和最后结构，原子序号和元素符号我都对好了的） 输入文件如下： %nprocshared=8 %mem=8GB %chk=mg4-h2-qst2.chk #p opt(calcfc,qst2,maxcycle=2000) freq=noraman b3pw91/6-311+g(d,p) empiricaldispersion=gd3 scf(maxcycle=2000,conver=6) nosymm mg4-h2-qst2 0 1 Mg -2.91504837 1.26284766 1.92151075 Mg -6.05287528 0.15350234 0.00000000 Mg -2.91508887 -2.06530526 0.00000000 Mg -2.91504837 1.26284766 -1.92151075 H -2.09425764 -4.95707567 0.32908968 H -1.73598875 -4.83041338 -0.32908968 mg4-h2-qst2 0 1 Mg 1.12634400 -1.03183000 -0.98056000 Mg 1.12757200 1.03115000 0.98044700 Mg -1.12733800 -0.98027800 1.03142900 Mg -1.12657400 0.98095100 -1.03131800 H 2.44087300 -0.00116900 -0.00039100 H -2.44092400 0.00124900 0.00041300 @Civolf 谢谢！！！！ |
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2014-10-21 22:17:13, 941 bytes
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sddtc888
至尊木虫 (著名写手)
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我按照您的方法，结果算出来了，你看一下对不对！ 还有，我想问一下，有了log文件，怎么看过渡态的结构，还有，怎么从log文件中看过渡态的频率（主要想看看是不是只有一个虚频），还有，过渡态每一步的能量怎么从log文件中提取 |
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2014-10-23 14:01:39, 1.58 M
9楼2014-10-23 14:01:13
【答案】应助回帖
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感谢参与，应助指数 +1
sddtc888: 金币+200, ★★★★★最佳答案, 谢谢！ 2014-10-25 13:52:22
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sddtc888: 金币+200, ★★★★★最佳答案, 谢谢！ 2014-10-25 13:52:22
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该问题是由于反应物和产物的结构相差过大，无法产生合适的内坐标而引起的。 解决方法是添加合适的虚拟键，使得反应物和产物具有相同的connectivity，这样有助于程序产生合适的内坐标 另外，maxcycle=2000不推荐，通常不能解决问题，还浪费计算时间；DFT缺省freq=noraman，所以只需写freq #p opt=(calcfc,qst2) freq b3pw91/6-311+g(d,p) nosymm geom=connectivity empiricaldispersion=gd3 mg4-h2-qst2 0 1 Mg -2.91504837 1.26284766 1.92151075 Mg -6.05287528 0.15350234 0.00000000 Mg -2.91508887 -2.06530526 0.00000000 Mg -2.91504837 1.26284766 -1.92151075 H -2.09425764 -4.95707567 0.32908968 H -1.73598875 -4.83041338 -0.32908968 1 2 0.5 5 0.5 3 0.5 4 0.5 2 5 0.5 4 0.5 3 4 0.5 6 0.5 4 6 0.5 5 6 0.5 6 mg4-h2-qst2 0 1 Mg 1.12634400 -1.03183000 -0.98056000 Mg 1.12757200 1.03115000 0.98044700 Mg -1.12733800 -0.98027800 1.03142900 Mg -1.12657400 0.98095100 -1.03131800 H 2.44087300 -0.00116900 -0.00039100 H -2.44092400 0.00124900 0.00041300 1 2 1.0 5 0.5 3 0.5 2 5 0.5 4 0.5 3 0.5 3 4 1.0 6 0.5 4 6 0.5 5 6 0.5 6 |
2楼2014-10-22 06:29:06
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