| 查看: 2097 | 回复: 8 | ||
[求助]
新手求助高斯输入文件写法，求大神帮忙
|
|
高斯的大神们，小弟菜鸟一枚，学的生物信息，最近课题需要涉及到量化计算，学高斯2天，想用QST2法求过渡态，我用的高斯09版，我自己写的输入文件如下，求大神指教为什么跑不起来. 文件如下： #T HF/6-311g(d,p) opt=QST2 Test H3H2COH->CH2CH2 Reactions 0,2 C 0.00000000 0.00000000 0.00000000 C 1.50025000 0.00000000 0.00000000 H -0.39511400 1.04493100 0.00000000 H -0.39533600 -0.52234200 -0.90492200 H -0.39539500 -0.52238700 0.90486300 H 1.89575000 -1.04467900 0.00006000 H 1.89527200 0.52254200 -0.90497800 Zn 2.64522939 1.51476738 2.62281261 H 4.19486823 1.49803410 2.59383901 H 2.14447048 2.98161913 2.63211125 H 2.14444092 0.78976911 3.89799432 O 2.00166469 0.66335397 1.14859428 H 2.88510506 0.27292590 0.98276594 H3H2COH->CH2CH2 Products 0,2 C 0.00000000 0.00000000 0.00000000 C -0.68224340 -1.17094448 0.00000000 H 1.07000000 0.00000000 0.00000000 H -0.53316375 0.92770492 0.00000000 H -0.91436330 -3.17239085 -0.86009004 H -1.75224340 -1.17094448 0.00000000 H -0.14907965 -2.09864940 0.00000000 Zn -1.81329368 -4.50558791 -1.87201667 H -0.88001965 -3.73027871 -2.83658664 H -2.77800070 -3.73151431 -0.93785907 H -1.78186071 -6.05497071 -1.84160431 O -1.43209302 -2.36411627 -0.87584280 H -2.36677428 -2.58252479 -0.89223333 |
回复此楼» 本帖已获得的红花（最新10朵）
师大心海无界» 猜你喜欢
纳米生物医用材料招研究生
已经有0人回复
-
乳腺癌骨健康全周期规范化管理指南
已经有0人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有281人回复
-
法国实验室招收高分子专业博士生
已经有10人回复
-
Jacs祈福
已经有63人回复
-
投稿的时候编辑发来邮件说作者机构信息没填写怎么办
已经有11人回复
-
想写一篇关于气液相变---临界点理论的文章，含气液界面张力。邀请感兴趣的同仁加入！
已经有6人回复
-
期刊投稿
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 怎样批量将sybyl mol2文件转换为高斯输入文件com或gjf格式（求脚本）
已经有22人回复
- 打算配置一个单8核的或者两个双4核的机器进行高斯计算，求大神指导如何装备
已经有11人回复
- B3LYP-D在高斯提交文件的关键词写法？
已经有6人回复
- 为什么一计算就会出现系统找不到指定文件呢？求高斯大神解答啊....
已经有5人回复
- 高斯09频率计算在服务器上停止计算，输出文件没有错误，求教大神指点
已经有10人回复
- 【求助】高斯自定义基组输入格式
已经有5人回复
- 【求助】求助高斯输入文件写法
已经有3人回复
- 【求助】高斯b3lyp/VDZ的输入文件写法
已经有14人回复
枪下游魂
木虫 (著名写手)
- 应助: 718 (博后)
- 金币: 8336.9
- 散金: 175
- 红花: 80
- 帖子: 1498
- 在线: 542.6小时
- 虫号: 2620258
- 注册: 2013-08-28
- 专业: 理论和计算化学
2楼2013-10-20 18:30:29
lishijunzong
铁杆木虫 (正式写手)
- 应助: 214 (大学生)
- 金币: 5034
- 红花: 10
- 帖子: 574
- 在线: 195.1小时
- 虫号: 1121020
- 注册: 2010-10-13
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
3楼2013-10-20 19:06:31
|
我是参考别人写的甲醛到甲醇的过渡态输入文件，文件如下： #T UHF/6-31G(d) opt=QST2 Test H3CO–>H2COH Reactions 0,2 C 0.00000000 0.00000000 0.00000000 H 0.00000000 0.00000000 1.07000001 H 1.00880579 0.00000000 -0.35666635 H -0.50440269 -0.87365135 -0.35666685 O -0.67410884 1.16759007 -0.47666623 H3CO–>H2COH Products 0,2 C 0.0000000 0.0000000 0.0000000 H 0.0000000 0.0000000 1.0700000 H 0.9277049 0.0000000 -0.5331638 H -1.3684675 0.9048960 -0.7874965 O -1.0873056 0.0000000 -0.6335117 他这个是可以跑的，而且结果是一样的，我觉得可能是我的反应体系里面多了个ZN，我的基组木有写对，但是我也木有看懂怎么写，报错的话是说的是2070，last link abnormally |
4楼2013-10-20 21:48:50
ZZU2011
木虫 (正式写手)
- 应助: 35 (小学生)
- 金币: 3257.1
- 散金: 1300
- 红花: 9
- 帖子: 458
- 在线: 109.9小时
- 虫号: 1681807
- 注册: 2012-03-11
- 专业: 理论和计算化学
5楼2013-10-20 22:00:53
ZZU2011
木虫 (正式写手)
- 应助: 35 (小学生)
- 金币: 3257.1
- 散金: 1300
- 红花: 9
- 帖子: 458
- 在线: 109.9小时
- 虫号: 1681807
- 注册: 2012-03-11
- 专业: 理论和计算化学
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★
gyc2011: 金币+5, ★★★★★最佳答案, 你太好了，木有试对不对，很有帮助 2013-10-20 22:20:44
gkf高: 金币+1 2013-10-21 09:58:47
gyc2011: 金币+5, ★★★★★最佳答案, 你太好了，木有试对不对，很有帮助 2013-10-20 22:20:44
gkf高: 金币+1 2013-10-21 09:58:47
| 不好意思，说错了一条，自旋多重度确实是2，按照你给的坐标，给你建了一个模型，不知道对不对 |
» 本帖附件资源列表
-
欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com - 附件 1 : aa.gjf
2013-10-20 22:07:48, 1.7 K
6楼2013-10-20 22:07:55
7楼2013-10-21 09:00:54
lishijunzong
铁杆木虫 (正式写手)
- 应助: 214 (大学生)
- 金币: 5034
- 红花: 10
- 帖子: 574
- 在线: 195.1小时
- 虫号: 1121020
- 注册: 2010-10-13
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
8楼2013-10-21 12:34:35
9楼2015-05-12 23:27:59
20