24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 2641  |  回复: 8

gyc2011

铁虫 (初入文坛)

[求助] 新手求助高斯输入文件写法,求大神帮忙

高斯的大神们,小弟菜鸟一枚,学的生物信息,最近课题需要涉及到量化计算,学高斯2天,想用QST2法求过渡态,我用的高斯09版,我自己写的输入文件如下,求大神指教为什么跑不起来.
  
文件如下:
#T HF/6-311g(d,p) opt=QST2 Test

H3H2COH->CH2CH2 Reactions

0,2
C   0.00000000    0.00000000    0.00000000
C   1.50025000    0.00000000    0.00000000
H  -0.39511400    1.04493100    0.00000000
H  -0.39533600   -0.52234200   -0.90492200
H  -0.39539500   -0.52238700    0.90486300
H   1.89575000   -1.04467900    0.00006000
H   1.89527200    0.52254200   -0.90497800
Zn  2.64522939    1.51476738    2.62281261
H   4.19486823    1.49803410    2.59383901
H   2.14447048    2.98161913    2.63211125
H   2.14444092    0.78976911    3.89799432
O   2.00166469    0.66335397    1.14859428
H   2.88510506    0.27292590    0.98276594

H3H2COH->CH2CH2 Products

0,2
C 0.00000000 0.00000000   0.00000000
C -0.68224340 -1.17094448   0.00000000
H 1.07000000 0.00000000   0.00000000
H -0.53316375 0.92770492   0.00000000
H -0.91436330 -3.17239085  -0.86009004
H -1.75224340 -1.17094448   0.00000000
H -0.14907965 -2.09864940   0.00000000
Zn -1.81329368 -4.50558791  -1.87201667
H -0.88001965 -3.73027871  -2.83658664
H -2.77800070 -3.73151431  -0.93785907
H -1.78186071 -6.05497071  -1.84160431
O -1.43209302 -2.36411627  -0.87584280
H -2.36677428 -2.58252479  -0.89223333
回复此楼

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

不以物喜不以己悲
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
我没试过过渡态,但看你的输入,一个问题可能是你只写了分子坐标而没有写分子间的成键状态。具体怎么写查查高斯说明书吧
2楼2013-10-20 18:30:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lishijunzong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
有什么报错信息,把信息帖出来。只看你这个也看不出个所以然
3楼2013-10-20 19:06:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gyc2011

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by lishijunzong at 2013-10-20 19:06:31
有什么报错信息,把信息帖出来。只看你这个也看不出个所以然

我是参考别人写的甲醛到甲醇的过渡态输入文件,文件如下:
#T UHF/6-31G(d) opt=QST2 Test

H3CO–>H2COH Reactions

0,2
C 0.00000000 0.00000000 0.00000000
H 0.00000000 0.00000000 1.07000001
H 1.00880579 0.00000000 -0.35666635
H -0.50440269 -0.87365135 -0.35666685
O -0.67410884 1.16759007 -0.47666623

H3CO–>H2COH Products

0,2
C 0.0000000 0.0000000 0.0000000
H 0.0000000 0.0000000 1.0700000
H 0.9277049 0.0000000 -0.5331638
H -1.3684675 0.9048960 -0.7874965
O -1.0873056 0.0000000 -0.6335117
他这个是可以跑的,而且结果是一样的,我觉得可能是我的反应体系里面多了个ZN,我的基组木有写对,但是我也木有看懂怎么写,报错的话是说的是2070,last link abnormally
不以物喜不以己悲
4楼2013-10-20 21:48:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ZZU2011

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gkf高: 金币+2 2013-10-21 09:58:28
首先,你的输入文件就有问题,既然是qst2方法找过渡态,为什么没有频率的计算,也就是说没有freq这一关键词,然后在电荷和自旋多重度之间不是逗号,而是空格;再者Zn是要用赝势基组的;第四,你的电荷是0,自旋多重度应该默认是1,而不是2。。。
5楼2013-10-20 22:00:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ZZU2011

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
gyc2011: 金币+5, ★★★★★最佳答案, 你太好了,木有试对不对,很有帮助 2013-10-20 22:20:44
gkf高: 金币+1 2013-10-21 09:58:47
不好意思,说错了一条,自旋多重度确实是2,按照你给的坐标,给你建了一个模型,不知道对不对

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : aa.gjf
  • 2013-10-20 22:07:48, 1.7 K
6楼2013-10-20 22:07:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chr0247

金虫 (小有名气)

电荷和自旋多重度之间,可以逗号,也可以空格,还可以tab

[ 发自小木虫客户端 ]
7楼2013-10-21 09:00:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lishijunzong

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by gyc2011 at 2013-10-20 21:48:50
我是参考别人写的甲醛到甲醇的过渡态输入文件,文件如下:
#T UHF/6-31G(d) opt=QST2 Test

H3CO–>H2COH Reactions

0,2
C 0.00000000 0.00000000 0.00000000
H 0.00000000 0.00000000 1.07000001
H  ...

看了你的输入文件,首先你把文件上最后一部分关于锌原子给去掉,然后。对于文件的作业名那部分,把#去掉应该就可以了
8楼2013-10-21 12:34:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

师大心海无界

新虫 (初入文坛)

送红花一朵
opt=(QST2,calcfc,noeigen)试试,你上面的那个写的有问题。
每天保持一颗快乐的心。
9楼2015-05-12 23:27:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 gyc2011 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 342求调剂 +4 加油a李zs 2026-03-26 4/200 2026-03-30 16:39 by 晶体之美
[考研] 本科211生物医学工程085409求调剂339分 +3 里子木yy 2026-03-29 3/150 2026-03-30 13:29 by gyzj2026
[考研] 材料与化工272求调剂 +21 阿斯蒂芬2004 2026-03-28 21/1050 2026-03-30 10:52 by 晴空210210
[考研] 375求调剂 +6 雨夏整夜 2026-03-29 6/300 2026-03-30 10:21 by herarysara
[考研] 337求调剂 +6 《树》 2026-03-29 6/300 2026-03-30 10:15 by herarysara
[考研] 求调剂 +10 张zz111 2026-03-27 11/550 2026-03-30 09:17 by 无际的草原
[考研] 281求调剂 +4 亚克西good 2026-03-26 6/300 2026-03-29 21:06 by 啊李999
[考研] 本科双非材料,跨考一志愿华电085801电气,283求调剂,任何专业都可以 +6 芝士雪baoo 2026-03-28 8/400 2026-03-29 08:16 by 松花缸1201
[考研] 316求调剂 +7 江辞666 2026-03-26 7/350 2026-03-28 21:28 by sanrepian
[考研] 085602 化工专硕 338分 求调剂 +12 路痴小琪 2026-03-27 12/600 2026-03-28 15:41 by L135790
[材料工程] 一志愿C9材料与化工专业总分300求调剂 +8 曼111 2026-03-24 9/450 2026-03-28 07:58 by YYYYX1234
[考研] 材料求调剂 一志愿哈工大总分298分,前三科223分 +5 dongfang59 2026-03-27 5/250 2026-03-28 04:53 by wxiongid
[考研] 0703化学求调剂,各位老师看看我!!! +5 祁祺祺 2026-03-25 5/250 2026-03-27 21:44 by 东方猪猪
[考研] 266分求材料化工冶金矿业等专业的调剂 +4 哇呼哼呼哼 2026-03-26 4/200 2026-03-27 17:02 by zhyzzh
[考研] 274求调剂 +17 顾九笙要谦虚 2026-03-24 23/1150 2026-03-27 15:16 by caszguilin
[考研] 复试调剂,一志愿南农083200食品科学与工程 +5 XQTJZ 2026-03-26 5/250 2026-03-27 14:49 by 狂炫麦当当
[硕博家园] 北京林业大学硕导招生广告 +6 kongweilin 2026-03-26 8/400 2026-03-27 10:18 by FF_16
[考研] 304材料求调剂 +4 钟llll 2026-03-26 4/200 2026-03-27 03:42 by wxiongid
[考研] 调剂求收留 +7 果然有我 2026-03-26 7/350 2026-03-27 00:26 by wxiongid
[考研] 打过很多竞赛,085406控制工程300分,求调剂 +3 askeladz 2026-03-26 3/150 2026-03-26 09:08 by 给你你注意休息
信息提示
请填处理意见