[交流] 【求助】求助高手一个做过渡态输入文件的问题 已有2人参与

Originally posted by logsh at 2010-05-19 19:38:00:
小弟最近在做吡啶硝化的过渡态计算，查了好多资料仍旧不清楚计算过渡态的输入文件该是什么样的，输入文件如下，请诸位高手帮忙指教。ps：我想使用扫面的方法找过渡态
%chk=3.chk
%mem=25MW
%nproc=1
# opt=(g ...

Originally posted by 467266420 at 2010-05-19 22:02:13:

改正如下：
1加上Opt=Z-matrix关键字
2分子坐标全换成符号化的内坐标形式

Originally posted by logsh at 2010-05-19 22:50:27:

劳烦，请问是这样加吗？

opt=(Z-matrix，gdiis,ts,CalcFC,noeigentest)

还有，请问什么是符号化内坐标呢？
麻烦你了

Originally posted by 467266420 at 2010-05-20 19:33:26:

对头。

符号化内坐标以水分子为例

0 1
o
h,1,B1
h,1,B2,2,A1

B1 0.96
B2 0.96
A1 104.5

Originally posted by logsh at 2010-05-21 22:01:47:


谢谢您的指点，我想请教一下，我是想用扫面的方式寻找过渡态的，请问我设定的r放在哪里呢？麻烦您了

Originally posted by 467266420 at 2010-05-22 09:08:04:



根据你的描述你是扫描N-C键
你可以写成
N  3   Bn 。 。。。

Bn  1.46320  s 20  0.05

各人觉得你原来的坐标如果全都符号化了，也是可以的，只是到2.2为止，是不是扫描距离太短了。