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小猫三两只

金虫 (正式写手)

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[求助] 鉴定拟南芥突变体是否为纯合已有1人参与

我有两个拟南芥突变体Salk_018985c和Salk_139697c，想鉴定下拟南芥突变体是否为纯合，请问怎么设计引物

网上查了一些设计的方法，我也没有看懂

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1楼 2014-09-28 20:18:51

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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

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【答案】应助回帖

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西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2014-09-28 23:37:33

这两个突变体名称都带c，应该已经是筛选过的纯合体。具体如何设计引物也不是一两句能说清楚，基本原理就是根据插入位点前后设计一对引物（LP、RP），载体pROK2上设计一条引物（LBP，这个引物序列在文献中有现成的），然后以每株待检材料DNA做模板，分别用LP+RP、LBP+RP扩增，根据产物大小及条带数目即可以判断是否纯合。给你一个参考网址，可以直接设计salk line引物，http://signal.salk.edu/tdnaprimers.2.html。搞懂原理也可以直接在tair上自己设计。