| 查看: 3323 | 回复: 6 | ||||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||||
敏sunflower金虫 (小有名气)
|
[交流]
速度自相关函数 已有4人参与
|
|||
|
对于分子模拟方法计算自扩散系数，有帖子提到可以用速度自相关函数来计算。而且，帖子中还有人提到，由于通过MSD-t曲线得到扩散系数的方法不是适用于所有的体系，相比之下，通过速度自相关函数求取更好！ 我有三方面有些不解，还请大家帮忙指点一二！ 1. 速度自相关函数计算扩散系数的方法适用于什么样的体系那? 所有的扩散都适合吗？ 2. MSD-t曲线球扩散系数的方法适用于什么样的体系呐？ 3.如果想通过速度自相关函数计算扩散系数的话，有没有相关的教程呐? 我看到有用LAMMPS软件做的，MS软件可不可以那？ |
回复此楼» 猜你喜欢
有多少人是今天查系统知道结果的？
已经有16人回复
-
系统查不到
已经有10人回复
-
基金不中，共勉
已经有3人回复
-
怎么查啊
已经有5人回复
-
范进中举一文的中心思想
已经有10人回复
-
我不理解！
已经有13人回复
-
2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战
已经有9人回复
-
2026国自然函评费到账
已经有25人回复
-
2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件，有关系吗？
已经有28人回复
-
能否退出参与的面上项目解除限项
已经有26人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 产气荚膜梭菌的相关问题。。。
已经有4人回复
- 用Lammps模拟计算水的密度
已经有10人回复
- 求助如何计算速度自相关函数。
已经有12人回复
- vasp5.2可以用linear response theory方法计算声子谱，声子态密度吗？？
已经有15人回复
- 求助LAMMPS两次运算结果不一致问题！
已经有11人回复
- 自相关函数的问题（autocorrelation function）
已经有5人回复
- 晶体密度计算的问题
已经有3人回复
- 一个信号的自相关函数说明的是什么呢
已经有15人回复
- 分子动力学模拟 求 水分子的红外光谱
已经有11人回复
- meta分析相关问题
已经有6人回复
- 经过MS模型导入到LAMMPS，在运算时出现的错误求助
已经有22人回复
- 关于傅里叶变换，为什么说经过这个积分处理，就把一个在时间域的函数转到频率域呢？
已经有10人回复
- 怎么做傅里叶变换
已经有10人回复
- 声子谱图（速度自相关函数的傅里叶变换之类的问题）
已经有9人回复
- [求助]自相关函数和统计分布的关系
已经有10人回复
- 怎么消除虚频，细节
已经有10人回复
- 求助：自相关函数是什么？
已经有3人回复
- 【求助】速度自相关函数怎么算
已经有4人回复
- 【讨论】自相关函数
已经有6人回复
6楼2015-04-09 20:14:52
lsloneil
专家顾问 (正式写手)
-
专家经验: +49 - 模拟EPI: 2
- 应助: 148 (高中生)
- 金币: 8640.9
- 散金: 507
- 红花: 30
- 帖子: 505
- 在线: 598.4小时
- 虫号: 556471
- 注册: 2008-05-11
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
- 管辖: 分子模拟
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
敏sunflower: 金币+10 2014-09-20 16:29:15
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
敏sunflower: 金币+10 2014-09-20 16:29:15
|
对于均一体系自扩散系数的计算，MSD与速度自相关函数两种方法是等价的。只是速度自相关函数技术上操作起来有时有点困难，如果采样不够长的话函数噪音很大，积分起来误差比较大。 对于大多数体系，自扩散系数足够表征扩散了。有些情况下，有人会研究互扩散系数，比如这个帖子 http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=7230279&fpage=1&target=blank 这里会用到速度关联函数的交叉形式。 对于非均一体系(anisotropic)体系，这是的自扩散系数不再是个常数，是个张量(diffusivity tensor），虽然这个张量在某些维度上的值仍然可以用MSD和速度自相关函数的分量来计算，但总体来讲这个情况比较复杂，需要特殊处理。 LAMMPS可以做VACF，material studio，我在网上搜了一下，貌似Forcite Plus可以做。你可以验证一下VACF和MSD得到的自扩散系数是否大致符合。 |
2楼2014-09-20 11:56:56
fwforest
金虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 3619.4
- 散金: 780
- 红花: 2
- 帖子: 270
- 在线: 399.4小时
- 虫号: 846321
- 注册: 2009-09-12
- 性别: GG
- 专业: 水文地质学(含地热地质学)
3楼2015-02-05 12:51:53
lsloneil
专家顾问 (正式写手)
-
专家经验: +49 - 模拟EPI: 2
- 应助: 148 (高中生)
- 金币: 8640.9
- 散金: 507
- 红花: 30
- 帖子: 505
- 在线: 598.4小时
- 虫号: 556471
- 注册: 2008-05-11
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
- 管辖: 分子模拟
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
abinitio: 金币+2, 感谢精彩应助！ 2015-02-06 08:59:00
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
abinitio: 金币+2, 感谢精彩应助！ 2015-02-06 08:59:00
|
难道你不看manual么？照着manual的例子先做一遍再说。 http://lammps.sandia.gov/doc/compute_vacf.html |
4楼2015-02-05 13:37:55
投票:
