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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 自相关函数的问题（autocorrelation function）
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xiaoke413

至尊木虫 (知名作家)

[求助] 自相关函数的问题（autocorrelation function） 已有2人参与

小弟在撰写一篇分子模拟类文章中，一个审稿人要求我提供体系中分子的回转半径（radius of gyration）的随时间变化的自相关函数（autocorrelation function），以此来判断体系是否平衡，所用公式如图，其中Rg是回转半径。我发现别人所做的自相关函数在初始时间（t=0）时为1，而我的体系的自相关函数在t=0时则大于1，这样子合理么？
自相关函数的问题（autocorrelation function）
公式


自相关函数的问题（autocorrelation function）-1
别人的图


自相关函数的问题（autocorrelation function）-2
我的图
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1楼 2014-01-24 19:54:17
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jerkwin

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
xiaoke413: 金币+20, ★★★很有帮助, 非常感谢您的回答，我想问一下，这公式里面的尖括号是什么意思啊？ 2014-01-25 07:39:59
月只蓝: 金币+1, 感谢指导 2014-01-25 19:51:33
如果你的计算公式没有错误, 直接归一化就可以了
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2楼2014-01-24 22:52:20
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jerkwin

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流 2014-01-25 19:52:22
引用回帖:
2楼: Originally posted by jerkwin at 2014-01-24 22:52:20
如果你的计算公式没有错误, 直接归一化就可以了

尖号的意思是求平均
更具体说是求系综平均
在算相关函数的时候需要移位相减以减小统计误差, 相当于系综平均
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xiaoke413
3楼2014-01-25 08:52:48
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xiaoke413

至尊木虫 (知名作家)
送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by jerkwin at 2014-01-25 08:52:48
尖号的意思是求平均
更具体说是求系综平均
在算相关函数的时候需要移位相减以减小统计误差, 相当于系综平均...

您好，感谢您的回答哦，麻烦您能否用matlab或相关软件编辑一下这个公式啊？对你来说应该很简单的~小弟是为了回复审稿意见，快截止了，到现在才发现这个问题，有点着急，不知道能否帮个忙，谢谢了
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4楼2014-01-25 09:24:31
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polypro

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流 2014-01-25 19:53:01
在你计算的Rg vs. t的数据中，乘以Rg(0)/Rg*约化初始值为1就可以了。现成的很多软件很方便做这事
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泉涸,鱼相与处于陆,相呴以湿,相濡以沫,不如相忘于江湖。
5楼2014-01-25 10:38:07
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wz_ding2011

木虫 (著名写手)
C是什么的自相关函数？
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6楼2015-03-17 20:40:55
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