1楼: Originally posted by xhzha at 2011-09-18 22:31:59:
大家好，用siesta算声子振动谱，出现虚频，如附件图所示，怎么消除虚频呢，我看到很多人讨论过，说提高收敛精度，还有就是用虚频对应的简正坐标加到体系的坐标上去，重新优化结构，再计算声子。我精度设到10-8，已 ...

2楼: Originally posted by yinwei_li at 2011-09-20 08:49:11:
有虚频说明你的结构动力学不稳定，原则上按照虚频的模式的原子振动方式移动原子（冷冻声子方法）可以找到动力学稳定的结构，但是你这个结构虚的太离谱，基本类似能带了，无法用冷冻声子计算。
虚频就虚频，为什 ...

3楼: Originally posted by xhzha at 2011-09-20 09:52:38:
谢谢您的回复，DFT优化是在初始模型的基础上小范围移动原子找到局域内稳定结构，可能并不是体系的最稳定结构，所以我就想按照虚频的原子振动方式移动原子，改变初始构型，优化找到动力学最稳定的结构，所以用这种 ...

3楼: Originally posted by xhzha at 2011-09-20 09:52:38:
谢谢您的回复，DFT优化是在初始模型的基础上小范围移动原子找到局域内稳定结构，可能并不是体系的最稳定结构，所以我就想按照虚频的原子振动方式移动原子，改变初始构型，优化找到动力学最稳定的结构，所以用这种 ...

5楼: Originally posted by yinwei_li at 2011-09-20 11:43:53:
补充：我做的一般都是晶体，三维的。你做的是纳米管，可能会有区别！你构造的纳米结构是不是本身就是一个近似结构？如果只是个近似结构，有虚频可能也很正常吧！

6楼: Originally posted by xhzha at 2011-09-20 16:43:13:
谢谢您的回复，我是用Material Studio 建的模型，然后用siesta去优化，但siesta只是局域内的稳定结构，所以我才想移动原子，调整结构试试。

7楼: Originally posted by yinwei_li at 2011-09-20 19:55:34:
MS建的模型是不是在一个大的框架里模拟纳米结构啊？这样的话有虚频可能很正常！因为你建的结构实际上还是有周期性的。不知道是否可以这样理解。

8楼: Originally posted by xhzha at 2011-09-21 08:07:27:
恩，我建的是周期性的结构，我的体系的键长等也是根据文献报导的结果得到的，所以初始模型可能会有点偏离。弱弱的问一句，虚频的本征矢是怎么得到的？

9楼: Originally posted by yinwei_li at 2011-09-21 09:47:49:
siesta没用过，具体不知道该怎么找，你可以找所有输出文件，看看有没有矩阵形势的，那个可能就是。建议咨询用过siesta的专家！