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敏sunflower

金虫 (小有名气)

[交流] 速度自相关函数 已有4人参与

对于分子模拟方法计算自扩散系数,有帖子提到可以用速度自相关函数来计算。而且,帖子中还有人提到,由于通过MSD-t曲线得到扩散系数的方法不是适用于所有的体系,相比之下,通过速度自相关函数求取更好!
我有三方面有些不解,还请大家帮忙指点一二!
1. 速度自相关函数计算扩散系数的方法适用于什么样的体系那? 所有的扩散都适合吗?
2. MSD-t曲线球扩散系数的方法适用于什么样的体系呐?
3.如果想通过速度自相关函数计算扩散系数的话,有没有相关的教程呐? 我看到有用LAMMPS软件做的,MS软件可不可以那?
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fwforest

金虫 (小有名气)


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2楼: Originally posted by lsloneil at 2014-09-20 11:56:56
对于均一体系自扩散系数的计算,MSD与速度自相关函数两种方法是等价的。只是速度自相关函数技术上操作起来有时有点困难,如果采样不够长的话函数噪音很大,积分起来误差比较大。

对于大多数体系,自扩散系数足够 ...

大神,请教一下,如何用lammps求速度自相关函数呢?由于本人是初学者,这个虽然也看了一些论文,但是论文上一般只给出公式和结果,搞了很长时间也没明白如何在in文件里面求这个量,请大神不吝赐教。
3楼2015-02-05 12:51:53
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fwforest

金虫 (小有名气)


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4楼: Originally posted by lsloneil at 2015-02-05 13:37:55
难道你不看manual么?照着manual的例子先做一遍再说。
http://lammps.sandia.gov/doc/compute_vacf.html...

多谢大神。不好意思,不知道compute命令可以直接算。多谢
5楼2015-02-06 01:40:54
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