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琢研

铜虫 (小有名气)

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在线: 121.5小时
虫号: 2760775
注册: 2013-10-28
性别: MM
专业: 微生物生态学

[交流] 真菌多样性相关问题已有1人参与

hello~小妹有个问题请教各位虫虫：一般采用高通量方法对温带或者亚热带森林土壤真菌多样性的研究中，一般ITS序列的因为选择什么比较合适呢？一般选择引物有什么规律吗？
另外：1、森林土壤总DNA的提取使用什么试剂盒较好？
2、ITS序列能够进行真菌+原生动物的研究么？
期待大神的回答~~~ 谢谢哒~~~~

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1楼 2014-08-19 22:24:14

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1902194422

铁杆木虫 (小有名气)

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在线: 105.8小时
虫号: 2670870
注册: 2013-09-22
性别: GG
专业: 环境微生物学

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖

ITS rRNA操纵子分为ITS1-5.8S-ITS2区。目前针对ITS1和ITS2区的引物都有很多，也没有统一的标准。看看参考文献自己选一个就行。
土壤DNA我们用的mbio的试剂盒。
真菌和原生动物的引物需要分别设计，不能同时扩增。

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有些梦，虽然遥不可及，但并不是不可实现.....

2楼2018-04-08 17:07:27