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renhuishuang

新虫 (小有名气)

[求助] 植物内生真菌多样性鉴定

哪位可以给指导一下 我想做植物内生真菌的多样性可培养不可培养的 构建 ITS 18SrDNA文库 我直接提取表面灭菌的植物组织的基因组 用通用引物ITS1-ITS4、NS1-NS8进行扩增 扩增出来的会不会还会有植物的基因 在植物中会不会与真菌的这两个片段具有同源性 这样做出来的文库可靠不
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安安的烦恼

铁虫 (小有名气)

楼主,这个问题弄明白了吗?可以不
2楼2013-07-29 14:59:37
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myco_lei

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
laozuzunzhe: 金币+2, 鼓励应助! 2013-07-29 20:16:44
我觉得不可培养的直接提,不容易提出来,相对于植物组织来说,内生菌应该太少了。培养出来的直接提菌丝比较可靠。
享受,把握现在!
3楼2013-07-29 15:49:40
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海骄子

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
首先你得保证所提的是内生真菌,而不是包含植物表面的真菌。其次你可以直接用植物的基因组为模板,用你的引物来扩增,若有产物测序比对即可。另外你可以采用宏基因组的方法来做!
4楼2013-07-29 22:16:47
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renhuishuang

新虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 海骄子 at 2013-07-29 22:16:47
首先你得保证所提的是内生真菌,而不是包含植物表面的真菌。其次你可以直接用植物的基因组为模板,用你的引物来扩增,若有产物测序比对即可。另外你可以采用宏基因组的方法来做!

植物肯定是表面消毒的 请指教如何用宏基因方法
5楼2013-07-30 09:35:55
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