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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 植物内生真菌多样性鉴定
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renhuishuang

新虫 (小有名气)

[求助] 植物内生真菌多样性鉴定

哪位可以给指导一下 我想做植物内生真菌的多样性可培养不可培养的 构建 ITS 18SrDNA文库 我直接提取表面灭菌的植物组织的基因组 用通用引物ITS1-ITS4、NS1-NS8进行扩增 扩增出来的会不会还会有植物的基因 在植物中会不会与真菌的这两个片段具有同源性 这样做出来的文库可靠不
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1楼 2013-07-29 10:07:01
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海骄子

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
首先你得保证所提的是内生真菌，而不是包含植物表面的真菌。其次你可以直接用植物的基因组为模板，用你的引物来扩增，若有产物测序比对即可。另外你可以采用宏基因组的方法来做！
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4楼2013-07-29 22:16:47
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安安的烦恼

铁虫 (小有名气)
楼主，这个问题弄明白了吗？可以不
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2楼2013-07-29 14:59:37
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myco_lei

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
laozuzunzhe: 金币+2, 鼓励应助！ 2013-07-29 20:16:44
我觉得不可培养的直接提，不容易提出来，相对于植物组织来说，内生菌应该太少了。培养出来的直接提菌丝比较可靠。
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享受，把握现在！
3楼2013-07-29 15:49:40
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renhuishuang

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 海骄子 at 2013-07-29 22:16:47
首先你得保证所提的是内生真菌，而不是包含植物表面的真菌。其次你可以直接用植物的基因组为模板，用你的引物来扩增，若有产物测序比对即可。另外你可以采用宏基因组的方法来做！

植物肯定是表面消毒的 请指教如何用宏基因方法
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5楼2013-07-30 09:35:55
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