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loveyouting

金虫 (小有名气)

[求助] MS模拟amorphous cell 已有1人参与

MS模拟amorphous cell 整个高分子链都在外面是什么情况，这样的盒子能用吗
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1楼 2014-08-07 10:35:11
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月只蓝

主管区长 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
loveyouting: 金币+5 2014-09-15 10:15:05
既然做成盒子了，就满足周期性边界条件，在视觉上的位置应该不影响。
如果你觉得不放心，可以多输出几个frames，选择一个你觉得合适的。
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MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助！时间精力有限，恕不接受无偿私信求助。
2楼2014-08-09 11:18:28
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loveyouting

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 月只蓝 at 2014-08-09 11:18:28
既然做成盒子了，就满足周期性边界条件，在视觉上的位置应该不影响。
如果你觉得不放心，可以多输出几个frames，选择一个你觉得合适的。

嗯，多谢啦，amorphous cell建模时，这个文献中的实验密度没有给出，应该怎么样呀
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3楼2014-08-19 10:25:14
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月只蓝

主管区长 (职业作家)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by loveyouting at 2014-08-19 10:25:14
嗯，多谢啦，amorphous cell建模时，这个文献中的实验密度没有给出，应该怎么样呀...

实验值或者自己计算出密度。
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MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助！时间精力有限，恕不接受无偿私信求助。
4楼2014-08-19 14:34:11
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金虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 月只蓝 at 2014-08-19 14:34:11
实验值或者自己计算出密度。...

自己从实验文献中计算
这个密度可以自己先设置一个target density，然后经过优化之后得到吗
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5楼2014-08-21 17:18:44
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loveyouting

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by loveyouting at 2014-08-19 10:25:14
嗯，多谢啦，amorphous cell建模时，这个文献中的实验密度没有给出，应该怎么样呀...

我做的高分子膜的盒子，这个密度应该是膜的密度还是高分子的密度呀
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6楼2014-09-05 14:28:38
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damihu2011

银虫 (职业作家)
请问楼主怎么建立的高分子盒子啊？也想建立高分子盒子，不知道怎么弄的……能说说你是怎么做到的吗？
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我的眼里只有苯环
7楼2014-12-04 21:27:00
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loveyouting

金虫 (小有名气)
用amorphous cell建，你可以看下这页的说明书，有详细的方法。
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8楼2014-12-05 08:48:43
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