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xiaoke413

至尊木虫 (职业作家)

[交流] 关于amorphous cell 构建完后的体系选择frame的问题

各位虫友，小弟用materials studio 中的amorphous cell 构建了一个体系，其中number of configuration 选择了10，我想问下，我想接下来做结构优化和动力学，该选哪一帧？
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1楼 2013-06-06 10:13:21
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gzl9901

铁杆木虫 (文坛精英)
★
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每天上小木虫，每天搞科研！
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2楼2013-06-06 10:53:15
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likang198802

银虫 (小有名气)
★ ★
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sunyang1988: 金币+1, 谢谢交流 2013-06-06 15:27:44
个人看法：体系大的话用分子动力学模块
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3楼2013-06-06 15:01:42
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xiaoke413

至尊木虫 (职业作家)
引用回帖:
3楼: Originally posted by likang198802 at 2013-06-06 15:01:42
个人看法：体系大的话用分子动力学模块

感谢您的回答，可能是我表达让你没理解，我只是用AC建立体系，然后从这10个构型中选择，然后接下来用discover来跑优化和动力学？我想问的就是这个构型选择该怎么选？谢谢哦~
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4楼2013-06-06 19:40:35
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likang198802

银虫 (小有名气)
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xiaoke413: 金币+1, 感谢交流 2013-06-07 09:35:47
sunyang1988: 金币+1, 谢谢交流 2013-06-07 09:38:28
引用回帖:
4楼: Originally posted by xiaoke413 at 2013-06-06 19:40:35
感谢您的回答，可能是我表达让你没理解，我只是用AC建立体系，然后从这10个构型中选择，然后接下来用discover来跑优化和动力学？我想问的就是这个构型选择该怎么选？谢谢哦~...

我也是刚接触这些，对这块也不是很熟，大家一起学习讨论，number of configuration 你选择了10，应该是指你在构建的模型里放入了10条链，然后你用这个模型做什么呢，如果掺杂的话，我想应该是在掺杂后再优化。对于你说的构型选择我还是没有理解，你只是建立了一个模型哦
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5楼2013-06-07 08:46:37
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xiaoke413

至尊木虫 (职业作家)
引用回帖:
5楼: Originally posted by likang198802 at 2013-06-07 08:46:37
我也是刚接触这些，对这块也不是很熟，大家一起学习讨论，number of configuration 你选择了10，应该是指你在构建的模型里放入了10条链，然后你用这个模型做什么呢，如果掺杂的话，我想应该是在掺杂后再优化。对于 ...

感谢你的回答哦，这里说的number of configurations 选择10是指ac在构建体系过程中创建了10不同的构型，而不是加入10条链，可能您理解错了，呵呵。
我要做的就是从中选择最合适的去进行接下来的结构优化和跑动力学，所以我选择想问的就是从该10个构型当中选择时有什么依据？
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6楼2013-06-07 09:26:56
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likang198802

银虫 (小有名气)
★
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引用回帖:
6楼: Originally posted by xiaoke413 at 2013-06-07 09:26:56
感谢你的回答哦，这里说的number of configurations 选择10是指ac在构建体系过程中创建了10不同的构型，而不是加入10条链，可能您理解错了，呵呵。
我要做的就是从中选择最合适的去进行接下来的结构优化和跑 ...

呵呵，闹了个小笑话，刚才看了一下，这个是指构建了10个不同的模型，
另外，选择10之后，只是出现了一个模型，另外的9个呢？
对于在选择最合适的去优化做动力学，不太清楚，抱歉了
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7楼2013-06-07 11:42:40
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hooge

木虫 (正式写手)
★
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这个和frame是不是一样的。这10个模型之间什么关系呢，能一，一分别输出吗？
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8楼2022-02-13 16:04:39
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