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qchj2004

金虫 (正式写手)

[交流] 构象搜索与能量优化有什么区别

我看计算方面的文献,总是对分子先进行构象搜索,再进行能量优化,不懂之处:构象搜索是计算各种构象的能量,选取最小值,能量优化也是选取最小值,他们二者到底有什么区别了,为什么不能一次进行完毕,非得按两次完成?
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xzh410512206

银虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
5楼: Originally posted by ChemiAndy at 2014-07-23 04:52:21
举个例子你就明白了,六元烷烃环有船式和椅式两种构型,你去做能量优化的话,最终得到船式还是椅式,取决于你输入进去的初始构型更靠近哪个。所以能量优化只能给出你一个优化好的结构,至于是不是还存在其它构象,它 ...

您说的我受益匪浅。。。那构象搜索和柔性扫描势能面有什么区别呢??我是这样做的:先对初始分子结构进行优化,得到一个稳定构象;然后在此基础进行柔性势能面scan,在势能曲线上找到 能量最小值。但我的问题是,初始优化得到的构象  一定是所有构象中最稳定的吗???
求解。。。感谢。。。。
6楼2015-06-06 09:15:03
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smutao

禁虫 (著名写手)

★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
qchj2004(月只蓝代发): 金币+1, 感谢指导! 2014-07-22 13:46:13
本帖内容被屏蔽

2楼2014-07-22 13:30:38
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qchj2004

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by smutao at 2014-07-22 13:30:38
不同的构象有不同的能量极小值 注意 是极小值

我在网上查了一下,知道如果不进行构象搜索的话,有可能得到的是局部最小,而不是全局最小,可是为什么:构象搜索就能全局搜索,而能量优化办不到了?再说构象搜索的本来搜索的就是单个构象,既然已经得到了全局最优,为何还要在此基础上能量优化了?构象搜索本来就是得到的单个构象啊!!!
3楼2014-07-22 17:09:12
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smutao

禁虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
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4楼2014-07-22 17:16:18
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